論文の概要: Deep Learning in Mining Biological Data
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2003.00108v1
- Date: Fri, 28 Feb 2020 23:14:27 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-12-28 01:55:13.395565
- Title: Deep Learning in Mining Biological Data
- Title(参考訳): 生物データのマイニングにおける深層学習
- Authors: Mufti Mahmud, M Shamim Kaiser, Amir Hussain
- Abstract要約: ディープラーニング(DL)は多くの複雑なパターン認識問題の解決に成功している。
本稿では,生物配列,画像,信号データへのDLの適用について述べる。
また、生物データのマイニングにおけるいくつかのオープンな研究課題についても概説している。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 7.834172629639729
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Recent technological advancements in data acquisition tools allowed life
scientists to acquire multimodal data from different biological application
domains. Broadly categorized in three types (i.e., sequences, images, and
signals), these data are huge in amount and complex in nature. Mining such an
enormous amount of data for pattern recognition is a big challenge and requires
sophisticated data-intensive machine learning techniques. Artificial neural
network-based learning systems are well known for their pattern recognition
capabilities and lately their deep architectures - known as deep learning (DL)
- have been successfully applied to solve many complex pattern recognition
problems. Highlighting the role of DL in recognizing patterns in biological
data, this article provides - applications of DL to biological sequences,
images, and signals data; overview of open access sources of these data;
description of open source DL tools applicable on these data; and comparison of
these tools from qualitative and quantitative perspectives. At the end, it
outlines some open research challenges in mining biological data and puts
forward a number of possible future perspectives.
- Abstract(参考訳): データ取得ツールの最近の技術進歩により、生命科学者は異なる生物学的応用領域からマルチモーダルデータを取得できるようになった。
これらのデータは3つのタイプ(シーケンス、画像、信号)に大別され、本質的には膨大な量と複雑である。
パターン認識のための膨大なデータマイニングは大きな課題であり、高度なデータ集約型機械学習技術を必要とする。
ニューラルネットワークに基づく学習システムはパターン認識能力で知られており、近年はディープラーニング(DL)として知られる深層アーキテクチャが、多くの複雑なパターン認識問題の解決に成功している。
本稿では, 生物データにおけるパターン認識におけるDLの役割を強調し, 生物学的シーケンス, 画像, 信号データへのDLの適用, オープンアクセスソースの概要, それらのデータに適用可能なオープンソースDLツールの記述, 質的, 定量的な観点からの比較を行う。
最後に、生物学データマイニングにおけるオープンリサーチの課題を概説し、将来的な展望を数多く提示する。
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