論文の概要: Single-shot autofocusing of microscopy images using deep learning
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2003.09585v2
- Date: Fri, 22 Jan 2021 06:20:14 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-12-21 12:48:24.245904
- Title: Single-shot autofocusing of microscopy images using deep learning
- Title(参考訳): 深層学習による顕微鏡画像の単発オートフォーカス
- Authors: Yilin Luo, Luzhe Huang, Yair Rivenson, Aydogan Ozcan
- Abstract要約: Deep-Rと呼ばれるディープラーニングベースのオフラインオートフォーカス手法は、ワンショット顕微鏡画像の高速かつ盲目的にオートフォーカスするように訓練されている。
Deep-Rは、通常のオンラインアルゴリズムのオートフォーカス手法と比較してかなり高速である。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.30586855806896046
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: We demonstrate a deep learning-based offline autofocusing method, termed
Deep-R, that is trained to rapidly and blindly autofocus a single-shot
microscopy image of a specimen that is acquired at an arbitrary out-of-focus
plane. We illustrate the efficacy of Deep-R using various tissue sections that
were imaged using fluorescence and brightfield microscopy modalities and
demonstrate snapshot autofocusing under different scenarios, such as a uniform
axial defocus as well as a sample tilt within the field-of-view. Our results
reveal that Deep-R is significantly faster when compared with standard online
algorithmic autofocusing methods. This deep learning-based blind autofocusing
framework opens up new opportunities for rapid microscopic imaging of large
sample areas, also reducing the photon dose on the sample.
- Abstract(参考訳): 本研究では,任意の非焦点面で取得した標本の単発顕微鏡像を迅速かつ盲目的にオートフォーカスするように訓練した,deep-rと呼ばれる深層学習型オフラインオートフォーカス法を示す。
本研究では,蛍光顕微鏡およびブライトフィールド顕微鏡を用いて撮影した各種組織断面を用いたdeep-rの有用性を示し,一様軸離焦点や視野内のサンプル傾きなどの異なるシナリオ下でのスナップショット自動フォーカスを示す。
この結果から,Deep-Rは従来のオンラインアルゴリズムのオートフォーカス手法に比べてはるかに高速であることがわかった。
このディープラーニングベースのブラインドオートフォーカスフレームワークは、大きなサンプル領域を高速に顕微鏡で撮影する新たな機会を開き、サンプルの光子線量を減らす。
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