論文の概要: SIA: A Scalable Interoperable Annotation Server for Biomedical Named Entities

• arxiv url: http://arxiv.org/abs/2004.03822v1
• Date: Wed, 8 Apr 2020 05:44:55 GMT
• ステータス: 処理完了
• システム内更新日: 2022-12-15 09:21:38.130066
• Title: SIA: A Scalable Interoperable Annotation Server for Biomedical Named Entities
• Title（参考訳）: SIA: バイオメディカルな名前付きエンティティのためのスケーラブルな相互運用可能なアノテーションサーバ
• Authors: Johannes Kirschnick, Philippe Thomas, Roland Roller, and Leonhard Hennig
• Abstract要約: SIAは、自由に利用可能なテキストマイニングと情報抽出ツールをカスタマイズされたソースに統合できるサーバである。 現在、このシステムは6つの名前のエンティティタイプ(ケミカル、疾患、遺伝子、突然変異、有機体)をカバーしており、Apache 2.0ライセンスの下でhttps://github.com/Erechtheus/siaで無料で利用できる。
• 参考スコア（独自算出の注目度）: 2.94824047753242
• License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
• Abstract: Recent years showed a strong increase in biomedical sciences and an inherent increase in publication volume. Extraction of specific information from these sources requires highly sophisticated text mining and information extraction tools. However, the integration of freely available tools into customized workflows is often cumbersome and difficult. We describe SIA (Scalable Interoperable Annotation Server), our contribution to the BeCalm-Technical interoperability and performance of annotation servers (BeCalm-TIPS) task, a scalable, extensible, and robust annotation service. The system currently covers six named entity types (i.e., Chemicals, Diseases, Genes, miRNA, Mutations, and Organisms) and is freely available under Apache 2.0 license at https://github.com/Erechtheus/sia.
• Abstract（参考訳）: 近年, バイオメディカル・サイエンスが著しく増加し, 出版量も増加している。 これらの情報源から特定の情報を抽出するには、高度に洗練されたテキストマイニングと情報抽出ツールが必要である。 しかし、自由に使えるツールとカスタマイズされたワークフローの統合は、しばしば面倒で難しいです。 SIA(Scalable Interoperable Annotation Server)は,BeCalm-Technicalの相互運用およびアノテーションサーバ(BeCalm-TIPS)タスクのパフォーマンス向上への貢献であり,スケーラブルで拡張性があり,堅牢なアノテーションサービスである。 現在、このシステムは6つの名前付きエンティティタイプ(ケミカル、疾患、遺伝子、miRNA、変異、有機体)をカバーしており、Apache 2.0ライセンスでhttps://github.com/Erechtheus/siaで無料で利用できる。

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