論文の概要: Annotating Social Determinants of Health Using Active Learning, and
Characterizing Determinants Using Neural Event Extraction
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2004.05438v2
- Date: Wed, 2 Dec 2020 05:54:50 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-12-14 10:09:19.084004
- Title: Annotating Social Determinants of Health Using Active Learning, and
Characterizing Determinants Using Neural Event Extraction
- Title(参考訳): アクティブラーニングによる健康の社会的要因の注釈とニューラルイベント抽出による要因の識別
- Authors: Kevin Lybarger, Mari Ostendorf, Meliha Yetisgen
- Abstract要約: 健康の社会的決定因子(SDOH)は健康に影響を及ぼし、SDOHの知識は臨床的な意思決定に影響を及ぼす。
本研究は,SDOHアノテーションを用いた新しいコーパス,新しいアクティブラーニングフレームワーク,新しいコーパスにおける最初の抽出結果を示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 11.845850292404768
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Social determinants of health (SDOH) affect health outcomes, and knowledge of
SDOH can inform clinical decision-making. Automatically extracting SDOH
information from clinical text requires data-driven information extraction
models trained on annotated corpora that are heterogeneous and frequently
include critical SDOH. This work presents a new corpus with SDOH annotations, a
novel active learning framework, and the first extraction results on the new
corpus. The Social History Annotation Corpus (SHAC) includes 4,480 social
history sections with detailed annotation for 12 SDOH characterizing the
status, extent, and temporal information of 18K distinct events. We introduce a
novel active learning framework that selects samples for annotation using a
surrogate text classification task as a proxy for a more complex event
extraction task. The active learning framework successfully increases the
frequency of health risk factors and improves automatic extraction of these
events over undirected annotation. An event extraction model trained on SHAC
achieves high extraction performance for substance use status (0.82-0.93 F1),
employment status (0.81-0.86 F1), and living status type (0.81-0.93 F1) on data
from three institutions.
- Abstract(参考訳): 健康の社会的決定因子(SDOH)は健康結果に影響を与え、SDOHの知識は臨床的意思決定に影響を及ぼす。
臨床テキストからSDOH情報を自動抽出するには、異種でしばしば重要なSDOHを含む注釈付きコーパスで訓練されたデータ駆動情報抽出モデルが必要である。
本研究は,SDOHアノテーションを用いた新しいコーパス,新しいアクティブラーニングフレームワーク,新しいコーパスにおける最初の抽出結果を示す。
社会史注釈コーパス(SHAC)には4,480の社会史セクションがあり、18Kの異なる出来事の状況、範囲、時間的情報を特徴づける12のSDOHに関する詳細な注釈がある。
本稿では,より複雑なイベント抽出タスクのプロキシとして,サロゲートテキスト分類タスクを用いてアノテーション用サンプルを選択する,新しいアクティブラーニングフレームワークを提案する。
アクティブラーニングフレームワークは、健康リスク要因の頻度を高め、非ダイレクトアノテーションによるこれらのイベントの自動抽出を改善する。
SHACを用いたイベント抽出モデルでは,3施設のデータから,物質使用状況(0.82-0.93 F1),雇用状況(0.81-0.86 F1),生活状況(0.81-0.93 F1)の抽出性能が高い。
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