論文の概要: COVID-19 identification in chest X-ray images on flat and hierarchical
classification scenarios
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2004.05835v3
- Date: Wed, 6 May 2020 14:15:00 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-12-13 23:15:58.727541
- Title: COVID-19 identification in chest X-ray images on flat and hierarchical
classification scenarios
- Title(参考訳): 平・階層分類における胸部X線画像中のCOVID-19の同定
- Authors: Rodolfo M. Pereira, Diego Bertolini, Lucas O. Teixeira, Carlos N.
Silla Jr., and Yandre M. G. Costa
- Abstract要約: 新型コロナウイルスは重篤な肺炎を引き起こす可能性があり、医療システムに高い影響を与えると推定されている。
本研究の目的は、CXR画像のみを用いて、他のタイプや健康な肺から新型コロナウイルスによる肺炎を同定することである。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.06157382820537718
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: The COVID-19 can cause severe pneumonia and is estimated to have a high
impact on the healthcare system. The standard image diagnosis tests for
pneumonia are chest X-ray (CXR) and computed tomography (CT) scan. CXR are
useful in because it is cheaper, faster and more widespread than CT. This study
aims to identify pneumonia caused by COVID-19 from other types and also healthy
lungs using only CXR images. In order to achieve the objectives, we have
proposed a classification schema considering the multi-class and hierarchical
perspectives, since pneumonia can be structured as a hierarchy. Given the
natural data imbalance in this domain, we also proposed the use of resampling
algorithms in order to re-balance the classes distribution. Our classification
schema extract features using some well-known texture descriptors and also
using a pre-trained CNN model. We also explored early and late fusion
techniques in order to leverage the strength of multiple texture descriptors
and base classifiers at once. To evaluate the approach, we composed a database,
named RYDLS-20, containing CXR images of pneumonia caused by different
pathogens as well as CXR images of healthy lungs. The classes distribution
follows a real-world scenario in which some pathogens are more common than
others. The proposed approach achieved a macro-avg F1-Score of 0.65 using a
multi-class approach and a F1-Score of 0.89 for the COVID-19 identification in
the hierarchical classification scenario. As far as we know, we achieved the
best nominal rate obtained for COVID-19 identification in an unbalanced
environment with more than three classes. We must also highlight the novel
proposed hierarchical classification approach for this task, which considers
the types of pneumonia caused by the different pathogens and lead us to the
best COVID-19 recognition rate obtained here.
- Abstract(参考訳): 新型コロナウイルス(covid-19)は重症肺炎を引き起こす可能性があり、医療システムに大きな影響を与えると推定されている。
肺炎の標準的な画像診断検査は、胸部x線(cxr)とct(ct)スキャンである。
CXRはCTよりも安価で、高速で、広く普及しているため有用である。
本研究は、cxr画像のみを用いて、他のタイプや健康な肺からcovid-19による肺炎を同定することを目的としている。
目的を達成するために,肺炎は階層構造として構成できるため,多類・階層的視点を考慮した分類スキーマを提案する。
この領域における自然データ不均衡を考えると、クラス分布の再均衡のために再サンプリングアルゴリズムも提案した。
分類スキーマは、よく知られたテクスチャ記述子と事前訓練されたCNNモデルを用いて特徴を抽出する。
また,複数のテクスチャ記述子とベース分類器の強度を同時に活用するために,早期および後期の融合手法についても検討した。
このアプローチを評価するために,異なる病原体による肺炎のcxr画像と健康な肺のcxr画像を含むrydls-20というデータベースを作成した。
クラス分布は、いくつかの病原体が他の病原体よりも一般的である現実世界のシナリオに従う。
提案手法は,マルチクラスアプローチによるマクロavg f1-score 0.65,階層分類シナリオにおけるcovid-19識別のためのf1-score 0.89を用いて達成した。
知る限り、私たちは3つ以上のクラスを持つ不均衡な環境で、新型コロナウイルスの診断で得られる最高の名目率を達成した。
また, 病原菌による肺炎の種類を考慮し, ここで得られた新型コロナウイルスの認識率を最も高く評価する, 新たな階層分類手法についても強調する必要がある。
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