論文の概要: Generalizability issues with deep learning models in medicine and their
potential solutions: illustrated with Cone-Beam Computed Tomography (CBCT) to
Computed Tomography (CT) image conversion
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2004.07700v2
- Date: Fri, 17 Apr 2020 14:50:39 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-12-12 22:21:28.278846
- Title: Generalizability issues with deep learning models in medicine and their
potential solutions: illustrated with Cone-Beam Computed Tomography (CBCT) to
Computed Tomography (CT) image conversion
- Title(参考訳): Cone-Beam Computed Tomography (CBCT) とComputed Tomography (CT) による医用深層学習モデルの一般化可能性問題とその潜在的な解決策
- Authors: Xiao Liang, Dan Nguyen, Steve Jiang
- Abstract要約: 一般化可能性は、あるデータセットでトレーニングされたディープラーニング(DL)モデルを他のデータセットに適用する場合の懸念である。
1台の機械と1台の解剖学的部位で訓練されたモデルが、他の機械や他の部位でどのように動作するかを検討した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.7714226334315324
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Generalizability is a concern when applying a deep learning (DL) model
trained on one dataset to other datasets. Training a universal model that works
anywhere, anytime, for anybody is unrealistic. In this work, we demonstrate the
generalizability problem, then explore potential solutions based on transfer
learning (TL) by using the cone-beam computed tomography (CBCT) to computed
tomography (CT) image conversion task as the testbed. Previous works have
converted CBCT to CT-like images. However, all of those works studied only one
or two anatomical sites and used images from the same vendor's scanners. Here,
we investigated how a model trained for one machine and one anatomical site
works on other machines and other sites. We trained a model on CBCT images
acquired from one vendor's scanners for head and neck cancer patients and
applied it to images from another vendor's scanners and for other disease
sites. We found that generalizability could be a significant problem for this
particular application when applying a trained DL model to datasets from
another vendor's scanners. We then explored three practical solutions based on
TL to solve this generalization problem: the target model, which is trained on
a target domain from scratch; the combined model, which is trained on both
source and target domain datasets from scratch; and the adapted model, which
fine-tunes the trained source model to a target domain. We found that when
there are sufficient data in the target domain, all three models can achieve
good performance. When the target dataset is limited, the adapted model works
the best, which indicates that using the fine-tuning strategy to adapt the
trained model to an unseen target domain dataset is a viable and easy way to
implement DL models in the clinic.
- Abstract(参考訳): 一般化可能性は、あるデータセットでトレーニングされたディープラーニング(DL)モデルを他のデータセットに適用する場合の懸念である。
誰でもどこでも使えるユニバーサルモデルのトレーニングは、非現実的です。
本研究では, 一般化可能性問題を実証し, コーンビームCT(CBCT)からCT(CT)画像変換タスクをテストベッドとして利用することで, 伝達学習(TL)に基づく潜在的な解を探索する。
これまでの研究はCBCTをCTライクな画像に変換してきた。
しかし、これらの研究はすべて1つか2つの解剖学的部位のみを研究し、同じベンダーのスキャナーの画像を使用した。
そこで本研究では,1台のマシンと1台の解剖学的サイトを訓練したモデルが,他のマシンや他のサイトでどのように機能するかについて検討した。
我々は,あるベンダーの頭頸部癌患者用スキャナーから取得したCBCT画像のモデルを訓練し,他のベンダーのスキャナーおよび他の病気部位用イメージに適用した。
我々は、他のベンダーのスキャナーのデータセットにトレーニング済みのDLモデルを適用する際に、この特定のアプリケーションにとって、一般化可能性が重要な問題となることを発見した。
次に、この一般化問題を解決するために、TLに基づく実用的な3つの解決策を探索した。対象ドメインをゼロからトレーニングするターゲットモデル、ソースとターゲットの両方のドメインデータセットをゼロからトレーニングする組み合わせモデル、トレーニングしたソースモデルをターゲットドメインに微調整する適応モデルである。
対象領域に十分なデータがある場合、3つのモデル全てが優れたパフォーマンスを達成できることがわかった。
ターゲットのデータセットが制限された場合、適応したモデルが最もうまく動作し、トレーニングされたモデルを対象とするドメインデータセットに適用するための微調整戦略を使用することは、クリニックでdlモデルを実装する上で有効で簡単な方法であることを示している。
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