論文の概要: MetricUNet: Synergistic Image- and Voxel-Level Learning for Precise CT
Prostate Segmentation via Online Sampling
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2005.07462v4
- Date: Sat, 23 Jan 2021 17:18:35 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-12-02 22:51:15.716048
- Title: MetricUNet: Synergistic Image- and Voxel-Level Learning for Precise CT
Prostate Segmentation via Online Sampling
- Title(参考訳): MetricUNet: オンラインサンプリングによる高精度CT前立腺分割のための合成画像とボクセルレベル学習
- Authors: Kelei He, Chunfeng Lian, Ehsan Adeli, Jing Huo, Yang Gao, Bing Zhang,
Junfeng Zhang, Dinggang Shen
- Abstract要約: 本稿では,前立腺領域を高速に局在させる第1段階と,前立腺領域を正確に区分する第2段階の2段階のフレームワークを提案する。
マルチタスクネットワークにおけるボクセルワイドサンプリングによる新しいオンラインメトリック学習モジュールを提案する。
本手法は,従来のクロスエントロピー学習法やDice損失学習法と比較して,より代表的なボクセルレベルの特徴を効果的に学習することができる。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 66.01558025094333
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Fully convolutional networks (FCNs), including UNet and VNet, are widely-used
network architectures for semantic segmentation in recent studies. However,
conventional FCN is typically trained by the cross-entropy or Dice loss, which
only calculates the error between predictions and ground-truth labels for
pixels individually. This often results in non-smooth neighborhoods in the
predicted segmentation. To address this problem, we propose a two-stage
framework, with the first stage to quickly localize the prostate region and the
second stage to precisely segment the prostate by a multi-task UNet
architecture. We introduce a novel online metric learning module through
voxel-wise sampling in the multi-task network. Therefore, the proposed network
has a dual-branch architecture that tackles two tasks: 1) a segmentation
sub-network aiming to generate the prostate segmentation, and 2) a voxel-metric
learning sub-network aiming to improve the quality of the learned feature space
supervised by a metric loss. Specifically, the voxel-metric learning
sub-network samples tuples (including triplets and pairs) in voxel-level
through the intermediate feature maps. Unlike conventional deep metric learning
methods that generate triplets or pairs in image-level before the training
phase, our proposed voxel-wise tuples are sampled in an online manner and
operated in an end-to-end fashion via multi-task learning. To evaluate the
proposed method, we implement extensive experiments on a real CT image dataset
consisting of 339 patients. The ablation studies show that our method can
effectively learn more representative voxel-level features compared with the
conventional learning methods with cross-entropy or Dice loss. And the
comparisons show that the proposed method outperforms the state-of-the-art
methods by a reasonable margin.
- Abstract(参考訳): unetやvnetを含む完全畳み込みネットワーク(fcns)は、セマンティックセグメンテーションのための広く使われているネットワークアーキテクチャである。
しかし、従来のfcnはクロスエントロピーやサイスロスによって訓練されており、ピクセルの予測と接地ラベルの誤差を個別に計算するだけである。
これはしばしば予測されたセグメンテーションの非スムース近傍をもたらす。
この問題に対処するために,前立腺領域を高速にローカライズする第1段階と,マルチタスクUNetアーキテクチャにより前立腺領域を正確に分割する第2段階の2段階のフレームワークを提案する。
マルチタスクネットワークにおけるボクセルワイドサンプリングによる新しいオンラインメトリック学習モジュールを提案する。
したがって,提案するネットワークは2つのタスクに対応するデュアルブランチアーキテクチャを有する。
1)前立腺セグメンテーション生成を目的としたセグメンテーションサブネットワーク、及び
2) 計量損失によって教師される学習特徴空間の品質向上を目的としたボクセルメトリック学習サブネットワーク。
具体的には、voxel-metric learningサブネットワークは、中間特徴マップを通じてvoxelレベルにあるタプル(三重項とペアを含む)をサンプリングする。
トレーニング前に画像レベルでトリプレットやペアを生成する従来のディープメトリック学習手法とは異なり,提案するvoxel-wiseタプルをオンライン形式でサンプリングし,マルチタスク学習によるエンドツーエンドで運用する。
提案手法を評価するために,339人の患者からなる実CT画像データセットについて広範な実験を行った。
アブレーション研究は,従来のクロスエントロピー法やダイス損失法に比べて,より代表的なボクセルレベルの特徴を効果的に学習できることを示した。
比較の結果,提案手法は最先端手法よりも合理的なマージンで優れていることがわかった。
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