論文の概要: Domain Adaptive Relational Reasoning for 3D Multi-Organ Segmentation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2005.09120v2
- Date: Sat, 11 Jul 2020 20:23:19 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-12-01 23:56:40.537288
- Title: Domain Adaptive Relational Reasoning for 3D Multi-Organ Segmentation
- Title(参考訳): 3次元マルチオーガンセグメンテーションのためのドメイン適応関係推論
- Authors: Shuhao Fu, Yongyi Lu, Yan Wang, Yuyin Zhou, Wei Shen, Elliot Fishman,
Alan Yuille
- Abstract要約: 本手法は,医用画像の内部構造間の空間的関係が比較的固定されていることに着想を得たものである。
我々はジグソーパズルタスクを解くことで空間的関係を定式化し、シャッフルパッチからCTスキャンを復元し、臓器分割タスクと共同で訓練する。
学習した空間関係が複数の領域に伝達可能であることを保証するため,1) 分割モデルと協調して訓練された超解像ネットワークを用いて,異なる領域からの医用画像の標準化,2) テスト時間ジグソーパズルトレーニングによるテスト画像の空間関係の適応,の2つのスキームを導入する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 17.504340316130023
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: In this paper, we present a novel unsupervised domain adaptation (UDA)
method, named Domain Adaptive Relational Reasoning (DARR), to generalize 3D
multi-organ segmentation models to medical data collected from different
scanners and/or protocols (domains). Our method is inspired by the fact that
the spatial relationship between internal structures in medical images is
relatively fixed, e.g., a spleen is always located at the tail of a pancreas,
which serves as a latent variable to transfer the knowledge shared across
multiple domains. We formulate the spatial relationship by solving a jigsaw
puzzle task, i.e., recovering a CT scan from its shuffled patches, and jointly
train it with the organ segmentation task. To guarantee the transferability of
the learned spatial relationship to multiple domains, we additionally introduce
two schemes: 1) Employing a super-resolution network also jointly trained with
the segmentation model to standardize medical images from different domain to a
certain spatial resolution; 2) Adapting the spatial relationship for a test
image by test-time jigsaw puzzle training. Experimental results show that our
method improves the performance by 29.60% DSC on target datasets on average
without using any data from the target domain during training.
- Abstract(参考訳): 本稿では,異なるスキャナーおよび/またはプロトコル(ドメイン)から収集した医療データに対して,3次元多臓器分割モデルを一般化するために,ドメイン適応関係推論(DARR)という新しいドメイン適応手法を提案する。
医用画像の内部構造間の空間的関係が比較的固定されていること,例えば,脾臓は常に膵尾部に位置し,複数の領域で共有される知識を伝達するための潜伏変数として機能するという事実に着想を得た。
我々は,ジグソーパズルタスク,すなわちシャッフルパッチからCTスキャンを復元し,臓器分割タスクと共同で訓練することにより,空間的関係を定式化する。
学習した空間関係の複数の領域への移動性を保証するため,2つのスキームを導入する。
1) 超解像ネットワークは,セグメンテーションモデルと共同で訓練し,異なる領域から特定の空間解像への医用画像の標準化を行う。
2) テスト時ジグソーパズル学習によるテスト画像の空間的関係の適応
実験結果から,本手法はトレーニング中に対象領域のデータを用いることなく,平均目標データセットの29.60%の性能向上を図っている。
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