論文の概要: Ensemble methods for survival function estimation with time-varying
covariates
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2006.00567v7
- Date: Fri, 3 Jun 2022 13:40:18 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-11-26 13:07:03.381888
- Title: Ensemble methods for survival function estimation with time-varying
covariates
- Title(参考訳): 時変共変量を用いた生存関数推定のためのアンサンブル法
- Authors: Weichi Yao and Halina Frydman and Denis Larocque and Jeffrey S.
Simonoff
- Abstract要約: 条件推論と相対リスク森林を一般化し、時間変化の共変を許容する。
Coxモデルとトランスフォーメーションフォレストのパフォーマンスを比較した。
概して、2つの提案された森林の性能はカプラン・マイアー推定よりも大幅に向上する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.10427337206896375
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Survival data with time-varying covariates are common in practice. If
relevant, they can improve on the estimation of survival function. However, the
traditional survival forests - conditional inference forest, relative risk
forest and random survival forest - have accommodated only time-invariant
covariates. We generalize the conditional inference and relative risk forests
to allow time-varying covariates. We also propose a general framework for
estimation of a survival function in the presence of time-varying covariates.
We compare their performance with that of the Cox model and transformation
forest, adapted here to accommodate time-varying covariates, through a
comprehensive simulation study in which the Kaplan-Meier estimate serves as a
benchmark, and performance is compared using the integrated L2 difference
between the true and estimated survival functions. In general, the performance
of the two proposed forests substantially improves over the Kaplan-Meier
estimate. Taking into account all other factors, under the proportional hazard
(PH) setting, the best method is always one of the two proposed forests, while
under the non-PH setting, it is the adapted transformation forest. K-fold
cross-validation is used as an effective tool to choose between the methods in
practice.
- Abstract(参考訳): 時変共変量による生存データは、実際には一般的である。
関連する場合は、生存機能の見積もりを改善することができる。
しかし、伝統的な生存林(条件推論林、相対リスク林、ランダムサバイバル林)は、時間不変の共変種のみを許容している。
条件推論と相対リスク森林を一般化し、時間変化の共変を許容する。
また,時間変動共変量の存在下での生存関数推定のための一般的な枠組みを提案する。
本稿では,カプラン・マイアーの推定値がベンチマークとして機能する包括的シミュレーション研究を通じて,Coxモデルと変換林の性能を比較し,実際の生存関数と推定された生存関数のL2差を用いた性能の比較を行った。
概して、2つの提案された森林の性能はカプラン・マイアー推定よりも大幅に向上する。
他のすべての要因を考慮に入れると、比例ハザード(ph)設定下では、最善の方法は、常に提案された2つの森林のうちの1つであり、非ph設定では、適応した変換森林である。
K-foldクロスバリデーションは、実際の方法を選択する効果的なツールとして使用される。
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