論文の概要: An Emergency Medical Services Clinical Audit System driven by Named
Entity Recognition from Deep Learning
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2007.03596v1
- Date: Tue, 7 Jul 2020 16:32:44 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-11-12 19:06:16.799384
- Title: An Emergency Medical Services Clinical Audit System driven by Named
Entity Recognition from Deep Learning
- Title(参考訳): 深層学習から名付けられたエンティティ認識による救急医療サービス臨床監査システム
- Authors: Wang Han, Wesley Yeung, Angeline Tung, Joey Tay Ai Meng, Davin
Ryanputera, Feng Mengling, Shalini Arulanadam
- Abstract要約: 本稿では, 階層型と非構造化型の両方の救急症例記録と, ディープニューラルネットワークを用いたエンティティ認識モデルを用いた臨床記録に基づく自動監査システムを提案する。
提案手法は,非構造的救急用フリーテキストレポートから臨床エンティティを確実に識別できる名前付きエンティティ認識モデルである。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Clinical performance audits are routinely performed in Emergency Medical
Services (EMS) to ensure adherence to treatment protocols, to identify
individual areas of weakness for remediation, and to discover systemic
deficiencies to guide the development of the training syllabus. At present,
these audits are performed by manual chart review which is time-consuming and
laborious. In this paper, we present an automatic audit system based on both
the structured and unstructured ambulance case records and clinical notes with
a deep neural network-based named entities recognition model. The dataset used
in this study contained 58,898 unlabelled ambulance incidents encountered by
the Singapore Civil Defence Force from 1st April 2019 to 30th June 2019. A
weakly-supervised training approach was adopted to label the sentences. Later
on, we trained three different models to perform the NER task. All three models
achieve F1 scores of around 0.981 under entity type matching evaluation and
around 0.976 under strict evaluation, while the BiLSTM-CRF model is 1~2 orders
of magnitude lighter and faster than our BERT-based models. Overall, our
approach yielded a named entity recognition model that could reliably identify
clinical entities from unstructured paramedic free-text reports. Our proposed
system may improve the efficiency of clinical performance audits and can also
help with EMS database research.
- Abstract(参考訳): 臨床成績監査は救急医療サービス(EMS)で定期的に行われ、治療プロトコルの遵守を確保し、治療のための個々の弱点を特定し、訓練用シラバスの発達を導くための体系的な欠陥を発見する。
現在、これらの監査は、時間と労力のかかる手動のチャートレビューによって実施されている。
本稿では,構造化と非構造化の両方の救急車症例記録と,ディープニューラルネットワークに基づくエンティティ認識モデルを用いた臨床ノートに基づく自動監査システムを提案する。
この研究で使用されたデータセットは、2019年4月1日から2019年6月30日までシンガポール民間防衛隊が遭遇した58,898件の無防備救急車事故を含む。
文章をラベル付けするために弱教師付きトレーニングアプローチが採用された。
その後、NERタスクを実行するために3つの異なるモデルを訓練しました。
3モデルともエンティティ型マッチング評価では0.981点,厳密評価では0.976点,BiLSTM-CRFモデルはBERTモデルより1~2桁ほど軽量で高速である。
提案手法は,非構造的救急用フリーテキストレポートから臨床エンティティを確実に識別できる名前付きエンティティ認識モデルを得た。
提案システムは,臨床成績監査の効率を向上し,EMSデータベースの研究にも役立てることができる。
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