論文の概要: Integrating Logical Rules Into Neural Multi-Hop Reasoning for Drug
Repurposing
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2007.05292v1
- Date: Fri, 10 Jul 2020 10:32:08 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-11-11 20:47:34.828285
- Title: Integrating Logical Rules Into Neural Multi-Hop Reasoning for Drug
Repurposing
- Title(参考訳): 神経マルチホップ推論への論理ルールの統合による薬物再導入
- Authors: Yushan Liu, Marcel Hildebrandt, Mitchell Joblin, Martin Ringsquandl,
Volker Tresp
- Abstract要約: 本稿では,これらのルールと強化学習を用いたニューラルマルチホップ推論手法を組み合わせた新しい手法を提案する。
バイオメディカル知識グラフHetionetに本手法を適用し,本手法がいくつかのベースライン法より優れていることを示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 23.783111050856245
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: The graph structure of biomedical data differs from those in typical
knowledge graph benchmark tasks. A particular property of biomedical data is
the presence of long-range dependencies, which can be captured by patterns
described as logical rules. We propose a novel method that combines these rules
with a neural multi-hop reasoning approach that uses reinforcement learning. We
conduct an empirical study based on the real-world task of drug repurposing by
formulating this task as a link prediction problem. We apply our method to the
biomedical knowledge graph Hetionet and show that our approach outperforms
several baseline methods.
- Abstract(参考訳): バイオメディカルデータのグラフ構造は、典型的なナレッジグラフベンチマークタスクのグラフ構造とは異なる。
バイオメディカルデータの特徴は、長距離依存の存在であり、論理的な規則として記述されたパターンによって捉えられる。
本稿では,これらのルールと強化学習を用いたニューラルマルチホップ推論手法を組み合わせた新しい手法を提案する。
我々は,この課題をリンク予測問題として定式化することにより,創薬の現実の課題に基づく実証研究を行う。
本手法をバイオメディカルナレッジグラフヘティネットに適用し,本手法がいくつかのベースライン手法よりも優れていることを示す。
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