論文の概要: A Dynamic Deep Neural Network For Multimodal Clinical Data Analysis
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2008.06294v1
- Date: Fri, 14 Aug 2020 11:19:32 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-10-30 16:54:39.482570
- Title: A Dynamic Deep Neural Network For Multimodal Clinical Data Analysis
- Title(参考訳): マルチモーダル臨床データ解析のための動的ディープニューラルネットワーク
- Authors: Maria H\"ugle, Gabriel Kalweit, Thomas Huegle and Joschka Boedecker
- Abstract要約: AdaptiveNetは、異なるイベントの複数のリストを扱うことができる、新しいリカレントニューラルネットワークアーキテクチャである。
慢性関節リウマチにおける疾患進展予測に,スイス臨床品質管理登録簿を用いてアーキテクチャを適用した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 12.02718865835448
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Clinical data from electronic medical records, registries or trials provide a
large source of information to apply machine learning methods in order to
foster precision medicine, e.g. by finding new disease phenotypes or performing
individual disease prediction. However, to take full advantage of deep learning
methods on clinical data, architectures are necessary that 1) are robust with
respect to missing and wrong values, and 2) can deal with highly variable-sized
lists and long-term dependencies of individual diagnosis, procedures,
measurements and medication prescriptions. In this work, we elaborate
limitations of fully-connected neural networks and classical machine learning
methods in this context and propose AdaptiveNet, a novel recurrent neural
network architecture, which can deal with multiple lists of different events,
alleviating the aforementioned limitations. We employ the architecture to the
problem of disease progression prediction in rheumatoid arthritis using the
Swiss Clinical Quality Management registry, which contains over 10.000 patients
and more than 65.000 patient visits. Our proposed approach leads to more
compact representations and outperforms the classical baselines.
- Abstract(参考訳): 電子カルテ、登録、治験からの臨床データは、新しい疾患の表現型の発見や個別の疾患予測などにより、精密な医学を育むために機械学習手法を適用するための大量の情報を提供する。
しかしながら,臨床データのディープラーニング手法を最大限に活用するには,アーキテクチャが必要である。
1)欠落値と誤値に関して頑健であり、
2) 個々の診断,処置,測定,服薬処方の長期的依存関係や,高度に変動したリストを扱うことができる。
本稿では,この文脈において,完全接続型ニューラルネットワークと古典的機械学習手法の制約を詳述するとともに,前述の制約を緩和し,異なる事象の複数のリストを処理可能な,新しいリカレントニューラルネットワークアーキテクチャであるadaptivenetを提案する。
スイス臨床品質管理登録簿(swiss clinical quality management registry)を用いて,関節リウマチの疾患進行予測の課題として,10万人以上の患者と65万人以上の患者を登録した。
提案手法はよりコンパクトな表現をもたらし、古典的ベースラインより優れる。
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