論文の概要: Quantifying the effect of image compression on supervised learning
applications in optical microscopy
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2009.12570v1
- Date: Sat, 26 Sep 2020 11:25:57 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-10-14 09:15:40.466807
- Title: Quantifying the effect of image compression on supervised learning
applications in optical microscopy
- Title(参考訳): 光顕微鏡における教師あり学習における画像圧縮の効果の定量化
- Authors: Enrico Pomarico, C\'edric Schmidt, Florian Chays, David Nguyen,
Arielle Planchette, Audrey Tissot, Adrien Roux, St\'ephane Pag\`es, Laura
Batti, Christoph Clausen, Theo Lasser, Aleksandra Radenovic, Bruno
Sanguinetti, and J\'er\^ome Extermann
- Abstract要約: 予測不能なアーティファクトを生成するために、画像圧縮のリスクが失われる。
オブジェクトと画像固有のセグメンテーションパラメータの予測は最大15%変更可能であることを示す。
SL支援フィールドにおける様々なデータ解析パイプラインを検証するために,本手法を一般化することができる。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 41.74498230885008
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: The impressive growth of data throughput in optical microscopy has triggered
a widespread use of supervised learning (SL) models running on compressed image
datasets for efficient automated analysis. However, since lossy image
compression risks to produce unpredictable artifacts, quantifying the effect of
data compression on SL applications is of pivotal importance to assess their
reliability, especially for clinical use. We propose an experimental method to
evaluate the tolerability of image compression distortions in 2D and 3D cell
segmentation SL tasks: predictions on compressed data are compared to the raw
predictive uncertainty, which is numerically estimated from the raw noise
statistics measured through sensor calibration. We show that predictions on
object- and image-specific segmentation parameters can be altered by up to 15%
and more than 10 standard deviations after 16-to-8 bits downsampling or JPEG
compression. In contrast, a recently developed lossless compression algorithm
provides a prediction spread which is statistically equivalent to that stemming
from raw noise, while providing a compression ratio of up to 10:1. By setting a
lower bound to the SL predictive uncertainty, our technique can be generalized
to validate a variety of data analysis pipelines in SL-assisted fields.
- Abstract(参考訳): 光顕微鏡におけるデータスループットの顕著な成長は、効率的な自動解析のために圧縮画像データセット上で実行される教師あり学習(SL)モデルを広く活用するきっかけとなった。
しかし, 画像圧縮のリスクが低いため, データ圧縮がSLアプリケーションに与える影響を定量化することが, 信頼性, 特に臨床応用において重要な課題である。
本研究では,2次元および3次元セルセグメンテーションslタスクにおける画像圧縮歪みの許容性を評価する実験手法を提案する。
16ビットから8ビットのダウンサンプリングやJPEG圧縮の後に、オブジェクトと画像固有のセグメンテーションパラメータの予測を最大15%、標準偏差10以上変更できることを示す。
対照的に、最近開発されたロスレス圧縮アルゴリズムは、生のノイズから生じるものと統計的に等価な予測スプレッドを提供し、圧縮比は最大10:1である。
SL予測の不確実性に対する低い境界を設定することで、SL支援フィールドにおける様々なデータ解析パイプラインを検証することができる。
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