論文の概要: Anomaly Detection Approach to Identify Early Cases in a Pandemic using
Chest X-rays
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2010.02814v2
- Date: Tue, 13 Apr 2021 19:54:28 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-10-10 06:20:26.608302
- Title: Anomaly Detection Approach to Identify Early Cases in a Pandemic using
Chest X-rays
- Title(参考訳): 胸部x線を用いたパンデミックの早期発見のための異常検出法
- Authors: Shehroz S. Khan, Faraz Khoshbakhtian, Ahmed Bilal Ashraf
- Abstract要約: あらゆるパンデミックにおいて重要な段階は、予防的治療と戦略を開発するための早期発見である。
新型コロナウイルスの症例では、胸部X線撮影で特徴的な異常がみられた。
本稿では,畳み込み型および逆向きに訓練されたオートエンコーダを含む,教師なしの深層学習手法を提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 3.9801611649762263
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: The current COVID-19 pandemic is now getting contained, albeit at the cost of
morethan2.3million human lives. A critical phase in any pandemic is the early
detection of cases to develop preventive treatments and strategies. In the case
of COVID-19,several studies have indicated that chest radiography images of the
infected patients show characteristic abnormalities. However, at the onset of a
given pandemic, such asCOVID-19, there may not be sufficient data for the
affected cases to train models for their robust detection. Hence, supervised
classification is ill-posed for this problem because the time spent in
collecting large amounts of data from infected persons could lead to the loss
of human lives and delays in preventive interventions. Therefore, we formulate
the problem of identifying early cases in a pandemic as an anomaly detection
problem, in which the data for healthy patients is abundantly available,
whereas no training data is present for the class of interest (COVID-19 in our
case). To solve this problem, we present several unsupervised deep learning
approaches, including convolutional and adversarially trained autoencoder. We
tested two settings on a publicly available dataset (COVIDx)by training the
model on chest X-rays from (i) only healthy adults, and (ii) healthy and other
non-COVID-19 pneumonia, and detected COVID-19 as an anomaly.
Afterperforming3-fold cross validation, we obtain a ROC-AUC of0.765. These
results are very encouraging and pave the way towards research for ensuring
emergency preparedness in future pandemics, especially the ones that could be
detected from chest X-rays
- Abstract(参考訳): 現在の新型コロナウイルス(COVID-19)のパンデミックは、人命230万ドルを犠牲にしているが、今や封じ込められている。
あらゆるパンデミックにおいて重要な段階は、予防治療や戦略を開発するための早期発見である。
新型コロナウイルス(covid-19)の症例では、胸部x線画像に特徴的な異常がみられた。
しかし、ascovid-19のようなパンデミックの発生時には、ロバストな検出のためにモデルをトレーニングするのに十分なデータがない可能性がある。
したがって、感染した人から大量のデータを集めるのに費やされる時間が、人命の喪失や予防介入の遅れにつながる可能性があるため、この問題は教師付き分類では不十分である。
そこで本研究では,パンデミックの早期患者を特定する問題は,健康な患者のデータが豊富に存在する異常検出問題として定式化されているが,興味のあるクラスにはトレーニングデータがない(本事例ではcovid-19)。
この問題を解決するために,convolutionalやadversarially training autoencoderなど,教師なしのディープラーニングアプローチをいくつか紹介する。
胸部X線でモデルをトレーニングすることで、公開データセット(COVIDx)上で2つの設定をテストした。
(i)健康な大人のみ、そして
(ii)健康および非共発性肺炎、及びcovid-19を異常として検出した。
3-fold cross validationの後、roc-auc (0.765) を得る。
これらの結果は、将来のパンデミック、特に胸部X線から検出できる緊急事態に備えた研究への道のりを大いに奨励している。
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