論文の概要: Accurate Calibration of Agent-based Epidemiological Models with Neural
Network Surrogates
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2010.06558v1
- Date: Tue, 13 Oct 2020 17:19:30 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-10-08 00:23:00.155483
- Title: Accurate Calibration of Agent-based Epidemiological Models with Neural
Network Surrogates
- Title(参考訳): ニューラルネットワークサーロゲートを用いたエージェントベース疫学モデルの正確な校正
- Authors: Rushil Anirudh, Jayaraman J. Thiagarajan, Peer-Timo Bremer, Timothy C.
Germann, Sara Y. Del Valle, Frederick H. Streitz
- Abstract要約: 我々は,米国の各大都市圏を対象とした大規模なシミュレーションアンサンブルを用いて,エージェントベースのモデルであるEpiCastを校正する新しいアプローチを提案する。
特に、全ての異なる位置を同時にエミュレートできる新しいニューラルネットワークベースのサロゲートモデルと、全てのパラメータのより正確な後続推定を提供するだけでなく、領域間のグローバルパラメータの結合フィッティングを可能にする新しい後続推定を提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 33.88734751290751
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Calibrating complex epidemiological models to observed data is a crucial step
to provide both insights into the current disease dynamics, i.e.\ by estimating
a reproductive number, as well as to provide reliable forecasts and scenario
explorations. Here we present a new approach to calibrate an agent-based model
-- EpiCast -- using a large set of simulation ensembles for different major
metropolitan areas of the United States. In particular, we propose: a new
neural network based surrogate model able to simultaneously emulate all
different locations; and a novel posterior estimation that provides not only
more accurate posterior estimates of all parameters but enables the joint
fitting of global parameters across regions.
- Abstract(参考訳): 複雑な疫学モデルを観測データに校正することは、現在の病気のダイナミクス、すなわち生殖数の推定と信頼性の高い予測とシナリオ探索の両方を提供するための重要なステップである。
本稿では,米国の主要都市圏の大規模シミュレーションアンサンブルを用いて,エージェントベースモデルであるエピキャストを校正する新しい手法を提案する。
特に、全ての異なる位置を同時にエミュレートできる新しいニューラルネットワークベースのサロゲートモデルと、全てのパラメータのより正確な後続推定を提供するだけでなく、領域間のグローバルパラメータの結合フィッティングを可能にする新しい後続推定を提案する。
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