論文の概要: Anatomically-Informed Deep Learning on Contrast-Enhanced Cardiac MRI for
Scar Segmentation and Clinical Feature Extraction
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2010.11081v2
- Date: Fri, 8 Jan 2021 21:04:30 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-10-05 00:45:39.544290
- Title: Anatomically-Informed Deep Learning on Contrast-Enhanced Cardiac MRI for
Scar Segmentation and Clinical Feature Extraction
- Title(参考訳): コントラスト強調心筋MRIを用いた解剖学的インフォームドディープラーニングと臨床像抽出
- Authors: Haley G. Abramson, Dan M. Popescu, Rebecca Yu, Changxin Lai, Julie K.
Shade, Katherine C. Wu, Mauro Maggioni, Natalia A. Trayanova
- Abstract要約: コントラスト・エンハンスメント(LGE)を用いた心臓磁気共鳴画像(CMR)による心臓の傷跡と線維化の可視化は、疾患の進行と不整脈の病態生理学的基質の定量化において最重要である。
本稿では,左室(LV)と難治/線維化分節の完全自動深層学習ソリューションと,LGE-CMRによる臨床像抽出について述べる。
この技術は、3つのカスケード畳み込みニューラルネットワークによって、生のLGE-CMR画像から心筋と線維化を分離し、解剖学的ガイドラインの中でこれらのセグメンテーションを拘束する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 6.386874708851962
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Visualizing disease-induced scarring and fibrosis in the heart on cardiac
magnetic resonance (CMR) imaging with contrast enhancement (LGE) is paramount
in characterizing disease progression and quantifying pathophysiological
substrates of arrhythmias. However, segmentation and scar/fibrosis
identification from LGE-CMR is an intensive manual process prone to large
inter-observer variability. Here, we present a novel fully-automated
anatomically-informed deep learning solution for left ventricle (LV) and
scar/fibrosis segmentation and clinical feature extraction from LGE-CMR. The
technology involves three cascading convolutional neural networks that segment
myocardium and scar/fibrosis from raw LGE-CMR images and constrain these
segmentations within anatomical guidelines, thus facilitating seamless
derivation of clinically-significant parameters. In addition to available
LGE-CMR images, training used "LGE-like" synthetically enhanced cine scans.
Results show excellent agreement with those of trained experts in terms of
segmentation (balanced accuracy of $96\%$ and $75\%$ for LV and scar
segmentation), clinical features ($2\%$ difference in mean scar-to-LV wall
volume fraction), and anatomical fidelity. Our segmentation technology is
extendable to other computer vision medical applications and to problems
requiring guidelines adherence of predicted outputs.
- Abstract(参考訳): コントラスト・エンハンスメント(LGE)を用いた心臓磁気共鳴画像(CMR)による心臓の傷跡と線維化の可視化は、疾患の進行と不整脈の病態生理学的基質の定量化において最重要である。
しかし、LGE-CMRからのセグメント化と傷痕・線維化の同定は、大きなサーバ間変動を引き起こす。
本稿では,左心室(LV)および難治/線維化分節とLGE-CMRの臨床的特徴抽出のための,完全自動解剖学的深層学習ソリューションを提案する。
この技術は、3つのカスケード畳み込みニューラルネットワークによって、生のLGE-CMR画像から心筋と線維化を分離し、解剖学的ガイドラインの範囲内でこれらのセグメンテーションを制限し、臨床的に重要なパラメータのシームレスな導出を容易にする。
利用可能なLGE-CMR画像に加えて、「LGEライク」なシンスキャンを用いたトレーニングも行われた。
以上の結果から, 訓練を受けた専門家は, セグメンテーション(lvとscarセグメンテーションの精度のバランスがよい), 臨床特徴(平均scar-to-lv壁容積率の差が2\%), 解剖学的忠実度, などの点で良好な一致を示した。
我々のセグメンテーション技術は、他のコンピュータビジョン医療アプリケーションや予測出力のガイドライン遵守を必要とする問題にも拡張可能である。
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