論文の概要: TeX-Graph: Coupled tensor-matrix knowledge-graph embedding for COVID-19
drug repurposing
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2010.11367v2
- Date: Sun, 25 Oct 2020 23:44:06 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-10-04 08:29:43.088374
- Title: TeX-Graph: Coupled tensor-matrix knowledge-graph embedding for COVID-19
drug repurposing
- Title(参考訳): TeX-Graph:COVID-19薬品精製のための複合テンソル・マトリクス知識グラフ
- Authors: Charilaos I. Kanatsoulis, and Nicholas D. Sidiropoulos
- Abstract要約: KG埋め込みのための新しい結合テンソル行列フレームワークを提案する。
テンソル因子化ツールを利用して、知識ベースにおける実体と関係の簡潔な表現を学習する。
提案する枠組みは原則的かつエレガントであり, 薬物再資源化作業における最良基準よりも100%改善されている。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 34.25102483600248
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Knowledge graphs (KGs) are powerful tools that codify relational behaviour
between entities in knowledge bases. KGs can simultaneously model many
different types of subject-predicate-object and higher-order relations. As
such, they offer a flexible modeling framework that has been applied to many
areas, including biology and pharmacology -- most recently, in the fight
against COVID-19. The flexibility of KG modeling is both a blessing and a
challenge from the learning point of view. In this paper we propose a novel
coupled tensor-matrix framework for KG embedding. We leverage tensor
factorization tools to learn concise representations of entities and relations
in knowledge bases and employ these representations to perform drug repurposing
for COVID-19. Our proposed framework is principled, elegant, and achieves 100%
improvement over the best baseline in the COVID-19 drug repurposing task using
a recently developed biological KG.
- Abstract(参考訳): 知識グラフ(kgs)は、知識ベースにおけるエンティティ間の関係的な振る舞いを体系化する強力なツールである。
KGは様々な種類の主観的対象と高次関係を同時にモデル化することができる。
そのため彼らは、生物学や薬理学など多くの分野に適用されている柔軟なモデリングフレームワークを提供している。
kgモデリングの柔軟性は、学習の観点からの祝福であり、挑戦でもある。
本稿では,kg埋め込みのための新しい結合テンソル行列フレームワークを提案する。
我々は、知識ベースにおける実体と関係の簡潔な表現を学ぶためにテンソル因子化ツールを利用し、これらの表現を用いてcovid-19の薬物再導入を行う。
提案する枠組みは原則的,エレガントで,最近開発された生物学的KGを用いて,新型コロナウイルス治療薬の回収作業における最良基準を100%改善する。
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