論文の概要: DeepRite: Deep Recurrent Inverse TreatmEnt Weighting for Adjusting
Time-varying Confounding in Modern Longitudinal Observational Data
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2010.15028v1
- Date: Wed, 28 Oct 2020 15:05:08 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-10-02 05:47:08.083071
- Title: DeepRite: Deep Recurrent Inverse TreatmEnt Weighting for Adjusting
Time-varying Confounding in Modern Longitudinal Observational Data
- Title(参考訳): DeepRite: 現代の縦断観測データにおける時間変化コンバウンディング調整のための逆処理量重み付け
- Authors: Yanbo Xu, Cao Xiao, Jimeng Sun
- Abstract要約: 時系列データにおける時間変化の相違に対するDeep Recurrent Inverse TreatmEnt重み付け(DeepRite)を提案する。
DeepRiteは、合成データから基底的真理を復元し、実際のデータから偏りのない処理効果を推定する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 68.29870617697532
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Counterfactual prediction is about predicting outcome of the unobserved
situation from the data. For example, given patient is on drug A, what would be
the outcome if she switch to drug B. Most of existing works focus on modeling
counterfactual outcome based on static data. However, many applications have
time-varying confounding effects such as multiple treatments over time. How to
model such time-varying effects from longitudinal observational data? How to
model complex high-dimensional dependency in the data? To address these
challenges, we propose Deep Recurrent Inverse TreatmEnt weighting (DeepRite) by
incorporating recurrent neural networks into two-phase adjustments for the
existence of time-varying confounding in modern longitudinal data. In phase I
cohort reweighting we fit one network for emitting time dependent inverse
probabilities of treatment, use them to generate a pseudo balanced cohort. In
phase II outcome progression, we input the adjusted data to the subsequent
predictive network for making counterfactual predictions. We evaluate DeepRite
on both synthetic data and a real data collected from sepsis patients in the
intensive care units. DeepRite is shown to recover the ground truth from
synthetic data, and estimate unbiased treatment effects from real data that can
be better aligned with the standard guidelines for management of sepsis thanks
to its applicability to create balanced cohorts.
- Abstract(参考訳): 事実予測とは、観測されていない状況の結果をデータから予測することである。
例えば、ある患者が薬物Aである場合、彼女が薬物Bに切り替えたらどうなるか。
しかし、多くの応用は時間とともに複数の治療のような時間的変動を伴う効果を持つ。
縦断観測データから時間変動効果をモデル化する方法
データの複雑な高次元依存をモデル化する方法?
そこで本研究では,2相の調整に再帰ニューラルネットワークを組み込むことにより,最近の縦断データに時間変動が組み合わさった場合の重み付け(deeprite)を提案する。
第i相コホート再重み付けでは、時間に依存する治療の逆確率を放出するために1つのネットワークに適合し、それらを使用して擬似バランスコホートを生成する。
フェーズIIの結果の進行では、修正されたデータをその後の予測ネットワークに入力し、偽の予測を行う。
集中治療室の敗血症患者から収集した合成データと実データからDeepRiteを評価した。
DeepRiteは、合成データから基礎的な真実を回復し、バランスの取れたコホートを作成できるため、敗血症管理の標準ガイドラインに適合し得る、実際のデータから偏りのない治療効果を推定する。
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