論文の概要: Weakly Supervised 3D Classification of Chest CT using Aggregated
Multi-Resolution Deep Segmentation Features
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2011.00149v1
- Date: Sat, 31 Oct 2020 00:16:53 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-10-01 04:55:53.758859
- Title: Weakly Supervised 3D Classification of Chest CT using Aggregated
Multi-Resolution Deep Segmentation Features
- Title(参考訳): Aggregated Multi-Resolution Deep Segmentation Features を用いた胸部CTの3次元分類
- Authors: Anindo Saha, Fakrul I. Tushar, Khrystyna Faryna, Vincent M.
D'Anniballe, Rui Hou, Maciej A. Mazurowski, Geoffrey D. Rubin, Joseph Y. Lo
- Abstract要約: CT画像の病巣分類は, 症例レベルのアノテーションが原因で, 局所性に乏しい。
マルチレゾリューション・セグメンテーション・フィーチャーマップを用いて学習した意味構造概念を活用する医療分類器を提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 5.938730586521215
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Weakly supervised disease classification of CT imaging suffers from poor
localization owing to case-level annotations, where even a positive scan can
hold hundreds to thousands of negative slices along multiple planes.
Furthermore, although deep learning segmentation and classification models
extract distinctly unique combinations of anatomical features from the same
target class(es), they are typically seen as two independent processes in a
computer-aided diagnosis (CAD) pipeline, with little to no feature reuse. In
this research, we propose a medical classifier that leverages the semantic
structural concepts learned via multi-resolution segmentation feature maps, to
guide weakly supervised 3D classification of chest CT volumes. Additionally, a
comparative analysis is drawn across two different types of feature aggregation
to explore the vast possibilities surrounding feature fusion. Using a dataset
of 1593 scans labeled on a case-level basis via rule-based model, we train a
dual-stage convolutional neural network (CNN) to perform organ segmentation and
binary classification of four representative diseases (emphysema,
pneumonia/atelectasis, mass and nodules) in lungs. The baseline model, with
separate stages for segmentation and classification, results in AUC of 0.791.
Using identical hyperparameters, the connected architecture using static and
dynamic feature aggregation improves performance to AUC of 0.832 and 0.851,
respectively. This study advances the field in two key ways. First, case-level
report data is used to weakly supervise a 3D CT classifier of multiple,
simultaneous diseases for an organ. Second, segmentation and classification
models are connected with two different feature aggregation strategies to
enhance the classification performance.
- Abstract(参考訳): CT画像の病気分類の弱さは、ケースレベルのアノテーションによるローカライゼーションの低下に悩まされており、正のスキャンでさえ、複数の平面に沿って数百から数千の負のスライスを保持することができる。
さらに、ディープラーニングのセグメンテーションと分類モデルは、同じターゲットクラス(es)から解剖学的特徴の明確な組み合わせを抽出するが、それらは通常、コンピュータ支援診断(CAD)パイプラインにおいて2つの独立したプロセスと見なされる。
本研究では,マルチ解像度セグメンテーション特徴マップから得られた意味的構造概念を活用し,胸部ctボリュームの弱い教師付き3次元分類を導く医用分類器を提案する。
さらに、比較分析は、特徴融合を取り巻く広大な可能性を探るため、2つの異なるタイプの特徴集約にまたがる。
ルールベースモデルを用いて,ケースレベルでラベル付けされた1593スキャンのデータセットを用いて,肺の4つの代表的な疾患(気腫,肺炎・気腫,腫瘤,結節)の臓器分節化と二分分類を行うために,二重段階畳み込みニューラルネットワーク(CNN)を訓練した。
セグメンテーションと分類の別々の段階を持つベースラインモデルは、AUCが0.791である。
同一のハイパーパラメータを用いて、静的および動的特徴集約を用いた接続アーキテクチャは、それぞれ0.832と0.851のAUCに性能を向上する。
この研究は2つの重要な方法で分野を前進させる。
まず、ケースレベルの報告データを用いて、臓器の複数の同時疾患の3DCT分類器を弱めに監督する。
第二に、セグメンテーションと分類モデルは2つの異なる特徴集約戦略と関連付けられ、分類性能が向上する。
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