論文の概要: TRACE: Early Detection of Chronic Kidney Disease Onset with
Transformer-Enhanced Feature Embedding
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2012.03729v1
- Date: Thu, 3 Dec 2020 01:23:39 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-05-23 14:47:49.479930
- Title: TRACE: Early Detection of Chronic Kidney Disease Onset with
Transformer-Enhanced Feature Embedding
- Title(参考訳): TRACE : Transformer-Enhanced Feature Embedding による慢性腎臓病の早期診断
- Authors: Yu Wang, Ziqiao Guan, Wei Hou, Fusheng Wang
- Abstract要約: TRACE(Transformer-RNN Autoencoder-enhanced CKD Detector)は、患者の医療履歴データを用いたエンドツーエンド予測モデルである。
TRACEは、病院訪問ごとにTransformer経由で埋め込まれた医療概念と、患者の医療史を要約した潜伏表現を学習する。
本モデルでは, 最適性能よりも相対的に2.31%向上した0.5708 AUPRCを達成している。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 5.649519919657841
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Chronic kidney disease (CKD) has a poor prognosis due to excessive risk
factors and comorbidities associated with it. The early detection of CKD faces
challenges of insufficient medical histories of positive patients and
complicated risk factors. In this paper, we propose the TRACE (Transformer-RNN
Autoencoder-enhanced CKD Detector) framework, an end-to-end prediction model
using patients' medical history data, to deal with these challenges. TRACE
presents a comprehensive medical history representation with a novel key
component: a Transformer-RNN autoencoder. The autoencoder jointly learns a
medical concept embedding via Transformer for each hospital visit, and a latent
representation which summarizes a patient's medical history across all the
visits. We compared TRACE with multiple state-of-the-art methods on a dataset
derived from real-world medical records. Our model has achieved 0.5708 AUPRC
with a 2.31% relative improvement over the best-performing method. We also
validated the clinical meaning of the learned embeddings through visualizations
and a case study, showing the potential of TRACE to serve as a general disease
prediction model.
- Abstract(参考訳): 慢性腎疾患(CKD)は、過剰な危険因子とそれに関連する合併症により予後不良である。
CKDの早期発見は、陽性患者の医療史と複雑な危険因子の不足に直面する。
本稿では,患者の医療履歴データを用いたエンドツーエンド予測モデルであるTRACE(Transformer-RNN Autoencoder-enhanced CKD Detector)フレームワークを提案する。
TRACEは、新しいキーコンポーネントであるTransformer-RNNオートエンコーダを備えた包括的医療史表現を提供する。
オートエンコーダは、病院訪問毎にトランスフォーマーによる医療概念の埋め込みと、全訪問にわたる患者の医療歴を要約した潜在表現を共同で学習する。
実世界の医療記録から得られたデータセットにおけるトレースと最先端の複数の手法を比較した。
提案手法は0.5708 auprcを達成し,2.31%の相対的改善が得られた。
また,可視化や症例スタディを通じて,学習した埋め込みの臨床的意義を検証し,一般的な疾患予測モデルとしてのTRACEの可能性を示した。
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