論文の概要: Deep Semi-Supervised Embedded Clustering (DSEC) for Stratification of
Heart Failure Patients
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2012.13233v3
- Date: Sun, 17 Jan 2021 23:51:44 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-04-25 08:11:03.048322
- Title: Deep Semi-Supervised Embedded Clustering (DSEC) for Stratification of
Heart Failure Patients
- Title(参考訳): 心不全患者に対する深部半監督型組込みクラスタリング(DSEC)
- Authors: Oliver Carr, Stojan Jovanovic, Luca Albergante, Fernando Andreotti,
Robert D\"urichen, Nadia Lipunova, Janie Baxter, Rabia Khan, Benjamin Irving
- Abstract要約: 本研究では、深層半教師付き組込みクラスタリングを用いて、心不全のデータ駆動型患者サブグループを決定する。
ヘテロジニアスデータから得られた組込み空間から臨床関連クラスタを見出した。
提案アルゴリズムは、異なる結果を持つ患者の新たな未診断サブグループを見つけることができる。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 50.48904066814385
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Determining phenotypes of diseases can have considerable benefits for
in-hospital patient care and to drug development. The structure of high
dimensional data sets such as electronic health records are often represented
through an embedding of the data, with clustering methods used to group data of
similar structure. If subgroups are known to exist within data, supervised
methods may be used to influence the clusters discovered. We propose to extend
deep embedded clustering to a semi-supervised deep embedded clustering
algorithm to stratify subgroups through known labels in the data. In this work
we apply deep semi-supervised embedded clustering to determine data-driven
patient subgroups of heart failure from the electronic health records of 4,487
heart failure and control patients. We find clinically relevant clusters from
an embedded space derived from heterogeneous data. The proposed algorithm can
potentially find new undiagnosed subgroups of patients that have different
outcomes, and, therefore, lead to improved treatments.
- Abstract(参考訳): 疾患の表現型を決定することは、病院内患者のケアや薬物開発にかなりの利益をもたらす。
電子健康記録のような高次元データセットの構造は、しばしば類似した構造のデータをグループ化するクラスタリング法を用いて、データの埋め込みを通して表現される。
サブグループがデータの中に存在することが分かっている場合、教師付き手法が発見されるクラスタに影響を与える可能性がある。
本稿では,半教師付き深層クラスタリングアルゴリズムに深層クラスタリングを拡張して,データ中の既知のラベルを通してサブグループを階層化する手法を提案する。
本研究では,4,487人の心不全とコントロール患者の電子健康記録から,データ駆動型心不全患者サブグループを決定するために,深層半教師付き組込みクラスタリングを適用した。
ヘテロジニアスデータから得られた組込み空間から臨床関連クラスタを見出した。
提案アルゴリズムは、異なる結果を持つ患者の新たな未診断サブグループを見つけることができるため、治療の改善につながる可能性がある。
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