論文の概要: Atlas-aware ConvNetfor Accurate yet Robust Anatomical Segmentation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2102.01256v1
- Date: Tue, 2 Feb 2021 02:06:06 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-02-04 04:59:22.089374
- Title: Atlas-aware ConvNetfor Accurate yet Robust Anatomical Segmentation
- Title(参考訳): アトラスアウェア ConvNetfor 正確かつロバストな解剖学的セグメンテーション
- Authors: Yuan Liang, Weinan Song, Jiawei Yang, Liang Qiu, Kun Wang, Lei He
- Abstract要約: 本稿では、確率論的アトラス事前を予測の明示的な制約として組み込んだ完全な畳み込み制約導入モジュール(CAM)を紹介する。
このようなアトラス前駆体融合の利点は2つの脳パーセレーションタスクで2倍になることを示す。
提案手法は,CAMを微調整し,精度とロバスト性の向上を図ることで,既存のConvNetに容易に適用できることを示唆している。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 14.187615351160021
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Convolutional networks (ConvNets) have achieved promising accuracy for
various anatomical segmentation tasks. Despite the success, these methods can
be sensitive to data appearance variations. Considering the large variability
of scans caused by artifacts, pathologies, and scanning setups, robust ConvNets
are vital for clinical applications, while have not been fully explored. In
this paper, we propose to mitigate the challenge by enabling ConvNets'
awareness of the underlying anatomical invariances among imaging scans.
Specifically, we introduce a fully convolutional Constraint Adoption Module
(CAM) that incorporates probabilistic atlas priors as explicit constraints for
predictions over a locally connected Conditional Random Field (CFR), which
effectively reinforces the anatomical consistency of the labeling outputs. We
design the CAM to be flexible for boosting various ConvNet, and compact for
co-optimizing with ConvNets for fusion parameters that leads to the optimal
performance. We show the advantage of such atlas priors fusion is two-fold with
two brain parcellation tasks. First, our models achieve state-of-the-art
accuracy among ConvNet-based methods on both datasets, by significantly
reducing structural abnormalities of predictions. Second, we can largely boost
the robustness of existing ConvNets, proved by: (i) testing on scans with
synthetic pathologies, and (ii) training and evaluation on scans of different
scanning setups across datasets. Our method is proposing to be easily adopted
to existing ConvNets by fine-tuning with CAM plugged in for accuracy and
robustness boosts.
- Abstract(参考訳): 畳み込みネットワーク(ConvNets)は、様々な解剖学的セグメンテーションタスクの有望な精度を達成しました。
成功にもかかわらず、これらの手法はデータの出現変動に敏感である。
アーティファクト,病理,スキャン設定によるスキャンの大きな変動を考えると,ロバストなConvNetは臨床応用には不可欠だが,十分に調査されていない。
本稿では,画像スキャン中の解剖学的不均一性に対するconvnetの認識を可能にすることで,課題を軽減することを提案する。
具体的には,局所接続条件付き確率場(cfr)上の予測に対する明示的な制約として確率的アトラス前置法を組み込んだ完全畳み込み制約導入モジュール(cam)を導入し,ラベリング出力の解剖学的一貫性を効果的に強化する。
さまざまなConvNetのブーストに柔軟に対応できるCAMを設計し、最適な性能につながるフュージョンパラメータをConvNetとの共同最適化にコンパクトにします。
このようなアトラス前駆体融合の利点は2つの脳パーセレーションタスクで2倍になることを示す。
まず,予測の構造的異常を著しく低減し,両データセットのConvNetに基づく手法間の最先端の精度を実現する。
第2に、既存のconvnetのロバスト性を大きく向上させることができる。(i) 合成病理によるスキャンのテスト、(ii) データセットをまたいだ異なるスキャンセットアップのスキャンのトレーニングと評価。
提案手法は,CAMを微調整し,精度とロバスト性の向上を図ることで,既存のConvNetに容易に適用できることを示唆している。
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