論文の概要: Automatic Segmentation of Organs-at-Risk from Head-and-Neck CT using
Separable Convolutional Neural Network with Hard-Region-Weighted Loss
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2102.01897v1
- Date: Wed, 3 Feb 2021 06:31:38 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-02-04 21:00:49.550966
- Title: Automatic Segmentation of Organs-at-Risk from Head-and-Neck CT using
Separable Convolutional Neural Network with Hard-Region-Weighted Loss
- Title(参考訳): 分割型畳み込みニューラルネットワークを用いた頭頸部ctによる臓器自動分節化
- Authors: Wenhui Lei, Haochen Mei, Zhengwentai Sun, Shan Ye, Ran Gu, Huan Wang,
Rui Huang, Shichuan Zhang, Shaoting Zhang, Guotai Wang
- Abstract要約: 鼻咽頭癌 (Nasopharyngeal Carcinoma, NPC) は, 北極, 中国, 東南アジア, 中東/北アフリカにおける頭頸部癌(HAN)の進行型である。
不確実性のあるCT画像からのOrgans-at-Risk(OAR)の正確なセグメンテーションは、NPC治療のための放射線治療を効果的に計画するために重要である。
本稿では,信頼性の高い不確実性推定を伴う高精度OARセグメンテーションのための新しいフレームワークを提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 10.93840864507459
- License: http://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/
- Abstract: Nasopharyngeal Carcinoma (NPC) is a leading form of Head-and-Neck (HAN)
cancer in the Arctic, China, Southeast Asia, and the Middle East/North Africa.
Accurate segmentation of Organs-at-Risk (OAR) from Computed Tomography (CT)
images with uncertainty information is critical for effective planning of
radiation therapy for NPC treatment. Despite the stateof-the-art performance
achieved by Convolutional Neural Networks (CNNs) for automatic segmentation of
OARs, existing methods do not provide uncertainty estimation of the
segmentation results for treatment planning, and their accuracy is still
limited by several factors, including the low contrast of soft tissues in CT,
highly imbalanced sizes of OARs and large inter-slice spacing. To address these
problems, we propose a novel framework for accurate OAR segmentation with
reliable uncertainty estimation. First, we propose a Segmental Linear Function
(SLF) to transform the intensity of CT images to make multiple organs more
distinguishable than existing methods based on a simple window width/level that
often gives a better visibility of one organ while hiding the others. Second,
to deal with the large inter-slice spacing, we introduce a novel 2.5D network
(named as 3D-SepNet) specially designed for dealing with clinic HAN CT scans
with anisotropic spacing. Thirdly, existing hardness-aware loss function often
deal with class-level hardness, but our proposed attention to hard voxels (ATH)
uses a voxel-level hardness strategy, which is more suitable to dealing with
some hard regions despite that its corresponding class may be easy. Our code is
now available at https://github.com/HiLab-git/SepNet.
- Abstract(参考訳): 鼻咽頭癌 (Nasopharyngeal Carcinoma, NPC) は, 北極, 中国, 東南アジア, 中東/北アフリカにおける頭頸部癌(HAN)の進行型である。
npc治療のための放射線治療の効果的な計画には不確かさ情報を有するct画像からの臓器・リスク(oar)の正確な分割が重要である。
コンボリューションニューラルネットワーク(CNN)がOARの自動セグメンテーションのために達成した最新のパフォーマンスにもかかわらず、既存の方法は治療計画のためのセグメンテーション結果の不確実性推定を提供しておらず、その精度はCTにおける軟部組織の低コントラスト、OARの高度に不均衡なサイズ、および大きなスライス間間隔を含むいくつかの要因によって制限されています。
これらの問題に対処するため,信頼性の高い不確実性推定を行うための新しいOARセグメンテーションフレームワークを提案する。
まず,SLF(Segmental Linear Function)を用いてCT画像の強度を変換し,複数の臓器を従来の方法よりも識別しやすくする手法を提案する。
第2に,大規模なスライス間スペーシングに対処するために,臨床用ハンctスキャンと異方性スペーシングを扱うために特別に設計された2.5dネットワーク(3d-sepnet)を導入する。
第3に,既存の硬度認識損失関数はクラスレベルの硬さに対処することが多いが,本提案した硬度ボクセル(ATH)に対する注意は,対応するクラスが容易であるにもかかわらず,いくつかの硬度領域を扱うのに適したボクセルレベルの硬さ戦略を用いている。
コードはhttps://github.com/HiLab-git/SepNetで入手できます。
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