論文の概要: A Deep Learning-Based Approach to Extracting Periosteal and Endosteal
Contours of Proximal Femur in Quantitative CT Images
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2102.01990v1
- Date: Wed, 3 Feb 2021 10:23:41 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-02-04 17:17:05.259813
- Title: A Deep Learning-Based Approach to Extracting Periosteal and Endosteal
Contours of Proximal Femur in Quantitative CT Images
- Title(参考訳): 定量的ct画像における大腿骨近位部および内膜輪郭の深部学習に基づく抽出法
- Authors: Yu Deng, Ling Wang, Chen Zhao, Shaojie Tang, Xiaoguang Cheng, Hong-Wen
Deng, Weihua Zhou
- Abstract要約: セグメンテーションタスクのために,3次元の終端(3D)完全畳み込みニューラルネットワークを開発した。
同一のネットワーク構造を持つ2つのモデルが訓練され、それぞれ腹腔内輪郭と内皮輪郭に対して97.87%と96.49%のサイコロ類似係数(DSC)を達成した。
大腿骨頚部骨折のリスク予測や有限要素解析などの臨床応用の可能性を示した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 25.76523855274612
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Automatic CT segmentation of proximal femur is crucial for the diagnosis and
risk stratification of orthopedic diseases; however, current methods for the
femur CT segmentation mainly rely on manual interactive segmentation, which is
time-consuming and has limitations in both accuracy and reproducibility. In
this study, we proposed an approach based on deep learning for the automatic
extraction of the periosteal and endosteal contours of proximal femur in order
to differentiate cortical and trabecular bone compartments. A three-dimensional
(3D) end-to-end fully convolutional neural network, which can better combine
the information between neighbor slices and get more accurate segmentation
results, was developed for our segmentation task. 100 subjects aged from 50 to
87 years with 24,399 slices of proximal femur CT images were enrolled in this
study. The separation of cortical and trabecular bone derived from the QCT
software MIAF-Femur was used as the segmentation reference. We randomly divided
the whole dataset into a training set with 85 subjects for 10-fold
cross-validation and a test set with 15 subjects for evaluating the performance
of models. Two models with the same network structures were trained and they
achieved a dice similarity coefficient (DSC) of 97.87% and 96.49% for the
periosteal and endosteal contours, respectively. To verify the excellent
performance of our model for femoral segmentation, we measured the volume of
different parts of the femur and compared it with the ground truth and the
relative errors between predicted result and ground truth are all less than 5%.
It demonstrated a strong potential for clinical use, including the hip fracture
risk prediction and finite element analysis.
- Abstract(参考訳): 整形外科疾患の診断とリスク層化には, 大腿骨近位部の自動CTセグメンテーションが重要であるが, 現在では, 手動の対話的セグメンテーションが中心であり, 精度と再現性に限界がある。
そこで本研究では,大腿骨近位部の骨膜および骨内輪郭の自動抽出法として,深層学習に基づくアプローチを提案する。
3次元(3次元)のエンドツーエンドの完全畳み込みニューラルネットワークは,隣接スライス間の情報をよりよく結合し,より正確なセグメンテーション結果を得ることができる。
対象は50歳から87歳までの100例で, 大腿骨近位部CT像は24,399スライスであった。
QCTソフトウェアMIAF-Femurから派生した皮質骨とトラベキュラー骨の分離をセグメンテーションリファレンスとして使用しました。
データセット全体を10倍のクロスバリデーションのための85項目のトレーニングセットと,モデルの性能評価のための15項目のテストセットにランダムに分割した。
同じネットワーク構造を持つ2つのモデルが訓練され、それぞれ周骨および内骨輪郭に対して97.87%および96.49%のダイス類似係数(DSC)を達成した。
大腿骨セグメンテーションモデルの優れた性能を検証するために,大腿骨の異なる部位の体積を測定し,基底真理と比較し,予測結果と基底真偽の相対誤差は5%以下であった。
股関節骨折のリスク予測や有限要素分析など,臨床応用への強力な可能性を示した。
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