論文の概要: Classification of COVID-19 via Homology of CT-SCAN
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2102.10593v1
- Date: Sun, 21 Feb 2021 12:18:38 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-02-23 14:38:35.415423
- Title: Classification of COVID-19 via Homology of CT-SCAN
- Title(参考訳): CT-SCANのホモロジーによるCOVID-19の分類
- Authors: Sohail Iqbal, H. Fareed Ahmed, Talha Qaiser, Muhammad Imran Qureshi,
Nasir Rajpoot
- Abstract要約: CTスキャン画像を用いたSARS-CoV-2の検出手法を提案する。
SARS-CoV-2の特徴をトポロジカル特性を定量化して主に追跡します。
モデル全体のベンチマークF1スコアは$99.42%、精度$99.416%、精度$99.41%、リコール$99.42%だった。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.624902795082451
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: In this worldwide spread of SARS-CoV-2 (COVID-19) infection, it is of utmost
importance to detect the disease at an early stage especially in the hot spots
of this epidemic. There are more than 110 Million infected cases on the globe,
sofar. Due to its promptness and effective results computed tomography
(CT)-scan image is preferred to the reverse-transcription polymerase chain
reaction (RT-PCR). Early detection and isolation of the patient is the only
possible way of controlling the spread of the disease. Automated analysis of
CT-Scans can provide enormous support in this process. In this article, We
propose a novel approach to detect SARS-CoV-2 using CT-scan images. Our method
is based on a very intuitive and natural idea of analyzing shapes, an attempt
to mimic a professional medic. We mainly trace SARS-CoV-2 features by
quantifying their topological properties. We primarily use a tool called
persistent homology, from Topological Data Analysis (TDA), to compute these
topological properties. We train and test our model on the "SARS-CoV-2 CT-scan
dataset" \citep{soares2020sars}, an open-source dataset, containing 2,481
CT-scans of normal and COVID-19 patients. Our model yielded an overall
benchmark F1 score of $99.42\% $, accuracy $99.416\%$, precision $99.41\%$, and
recall $99.42\%$. The TDA techniques have great potential that can be utilized
for efficient and prompt detection of COVID-19. The immense potential of TDA
may be exploited in clinics for rapid and safe detection of COVID-19 globally,
in particular in the low and middle-income countries where RT-PCR labs and/or
kits are in a serious crisis.
- Abstract(参考訳): SARS-CoV-2(COVID-19)感染の世界的な広がりでは、特にこの流行のホットスポットで早期に病気を検出することが非常に重要です。
世界には110万人以上の感染者がいます、ソファー。
逆転写ポリメラーゼ連鎖反応(RT-PCR)には、その迅速性および有効結果のCTスキャン画像が好ましい。
患者の早期発見と分離は、病気の広がりを制御する唯一の可能な方法です。
CT-Scansの自動解析は、このプロセスにおいて大きな支援を提供することができる。
本稿では,CTスキャン画像を用いたSARS-CoV-2検出手法を提案する。
本手法は,非常に直感的で自然な形状解析の考え方に基づいており,専門医を模倣する試みである。
SARS-CoV-2の特徴をトポロジカル特性を定量化して主に追跡します。
私たちは主にトポロジカルデータ分析(TDA)から永続ホモロジーと呼ばれるツールを使用して、これらのトポロジカル特性を計算します。
我々は,sars-cov-2 ct-scanデータセット (sars-cov-2 ct-scan dataset) \citep{soares2020sars} のトレーニングとテストを行った。
我々のモデルは、全体的なベンチマークf1スコアを99.42\%$、精度99.416\%$、精度99.41\%$、そして99.42\%$をリコールしました。
TDA技術には、新型コロナウイルスの効率的かつ迅速な検出に使用できる大きなポテンシャルがあります。
特にRT-PCRラボやキットが深刻な危機に陥っている低所得国では、TDAの潜在能力は、世界的な新型コロナウイルスの迅速かつ安全な検出のためにクリニックで活用される可能性がある。
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