論文の概要: Post-hoc Overall Survival Time Prediction from Brain MRI
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2102.10765v1
- Date: Mon, 22 Feb 2021 04:27:03 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-02-24 03:03:26.881462
- Title: Post-hoc Overall Survival Time Prediction from Brain MRI
- Title(参考訳): 脳MRIによるポストホック全生存時間予測
- Authors: Renato Hermoza, Gabriel Maicas, Jacinto C. Nascimento, Gustavo
Carneiro
- Abstract要約: トレーニングにセグメンテーションマップアノテーションを必要としないOS時間予測のための新しいポストホック手法を提案する。
本モデルでは,OSの時間と腫瘍の局在を推定するために,医用画像と患者の人口動態を入力として用いた。
トレーニングにセグメンテーションラベルを必要としないという利点を生かして、プレホックメソッドに比べて競争力のある結果が得られる。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 25.6451669155944
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Overall survival (OS) time prediction is one of the most common estimates of
the prognosis of gliomas and is used to design an appropriate treatment
planning. State-of-the-art (SOTA) methods for OS time prediction follow a
pre-hoc approach that require computing the segmentation map of the glioma
tumor sub-regions (necrotic, edema tumor, enhancing tumor) for estimating OS
time. However, the training of the segmentation methods require ground truth
segmentation labels which are tedious and expensive to obtain. Given that most
of the large-scale data sets available from hospitals are unlikely to contain
such precise segmentation, those SOTA methods have limited applicability. In
this paper, we introduce a new post-hoc method for OS time prediction that does
not require segmentation map annotation for training. Our model uses medical
image and patient demographics (represented by age) as inputs to estimate the
OS time and to estimate a saliency map that localizes the tumor as a way to
explain the OS time prediction in a post-hoc manner. It is worth emphasizing
that although our model can localize tumors, it uses only the ground truth OS
time as training signal, i.e., no segmentation labels are needed. We evaluate
our post-hoc method on the Multimodal Brain Tumor Segmentation Challenge
(BraTS) 2019 data set and show that it achieves competitive results compared to
pre-hoc methods with the advantage of not requiring segmentation labels for
training.
- Abstract(参考訳): 総合生存時間予測はグリオーマの予後の最も一般的な推定値の1つであり、適切な治療計画を設計するために使用される。
OSタイム予測のための最先端の(SOTA)手法は、OSタイムを推定するためにグリオーマ腫瘍サブリージョン(壊死性、浮腫性腫瘍、増強腫瘍)のセグメンテーションマップを計算する必要があるプリホックアプローチに従います。
しかし, セグメンテーション手法の訓練には, 難易度が高く, 入手に費用がかかる地下の真理セグメンテーションラベルが必要である。
病院から入手可能な大規模なデータセットの多くは、そのような正確なセグメンテーションを含まないため、これらのSOTA手法は適用範囲が限られている。
本稿では,訓練用セグメンテーションマップアノテーションを必要としないOS時間予測のためのポストホック法を提案する。
本モデルでは,手術画像と患者の人口統計(年齢別に表される)を入力として,OS時刻を推定し,腫瘍を局在化するサリエンシーマップを推定し,OS時刻予測をポストホックな方法で説明する。
私たちのモデルは腫瘍を局在化することができますが、トレーニング信号として地上の真実のOS時間のみを使用する、すなわちセグメンテーションラベルは必要ありません。
マルチモーダル脳腫瘍分画チャレンジ(brats)2019データセットのポストホック法を評価し,トレーニングに分節ラベルを必要とせず,プレホック法と比較して競争力のある結果が得られることを示した。
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