論文の概要: Heterogeneous electronic medical record representation for similarity
computing
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2104.14229v1
- Date: Thu, 29 Apr 2021 09:38:14 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-04-30 12:46:55.226056
- Title: Heterogeneous electronic medical record representation for similarity
computing
- Title(参考訳): 類似性計算のための異種電子カルテ表現
- Authors: Hoda Memarzadeh, Nasser Ghadiri, Maryam Lotfi Shahreza and Suresh
Pokharel
- Abstract要約: 患者類似度評価は、特定の患者に類似している患者を識別するための二次タスクの1つです。
本稿では,EMR(Electronic Medical Records)の新しいデータ表現手法について検討する。
本研究では,非構造化データと構造化データを用いて,症状,症状,疾患を含むさまざまな医療イベントの同時発生を捉える手法を提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 3.039568795810294
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Due to the widespread use of tools and the development of text processing
techniques, the size and range of clinical data are not limited to structured
data. The rapid growth of recorded information has led to big data platforms in
healthcare that could be used to improve patients' primary care and serve
various secondary purposes. Patient similarity assessment is one of the
secondary tasks in identifying patients who are similar to a given patient, and
it helps derive insights from similar patients' records to provide better
treatment. This type of assessment is based on calculating the distance between
patients. Since representing and calculating the similarity of patients plays
an essential role in many secondary uses of electronic records, this article
examines a new data representation method for Electronic Medical Records (EMRs)
while taking into account the information in clinical narratives for similarity
computing. Some previous works are based on structured data types, while other
works only use unstructured data. However, a comprehensive representation of
the information contained in the EMR requires the effective aggregation of both
structured and unstructured data. To address the limitations of previous
methods, we propose a method that captures the co-occurrence of different
medical events, including signs, symptoms, and diseases extracted via
unstructured data and structured data. It integrates data as discriminative
features to construct a temporal tree, considering the difference between
events that have short-term and long-term impacts. Our results show that
considering signs, symptoms, and diseases in every time interval leads to less
MSE and more precision compared to baseline representations that do not
consider this information or consider them separately from structured data.
- Abstract(参考訳): ツールの普及とテキスト処理技術の発達により,臨床データのサイズや範囲は構造化データに限定されない。
記録情報の急速な増加は、患者のプライマリケアを改善し、様々なセカンダリな目的に役立てるために使用できる医療におけるビッグデータプラットフォームに繋がった。
患者類似度評価は、患者と類似した患者を特定するための二次的なタスクの一つであり、類似した患者の記録から洞察を導き、より良い治療を提供するのに役立つ。
この種の評価は患者間の距離を計算することに基づいている。
電子カルテ(EMR)における患者間の類似性の表現と計算は,多くの電子カルテの二次的使用において重要な役割を担っているため,類似性計算のための臨床物語の情報を考慮しつつ,新たなデータ表現法について検討する。
以前の作品は構造化データ型に基づいているが、他の作品は非構造化データのみを使用している。
しかし、EMRに含まれる情報の包括的な表現には、構造化データと非構造化データの両方を効果的に集約する必要がある。
従来手法の限界に対処するため,非構造化データや構造化データから抽出した徴候,症状,疾患など,さまざまな医療イベントの同時発生を捉える手法を提案する。
短期的および長期的影響を持つ事象の違いを考慮して、データは時間木を構成する識別的特徴として統合される。
以上の結果から,各時間間隔で徴候,症状,疾患を考慮すれば,この情報を考慮しないベースライン表現や構造化データと別々に考慮するベースライン表現に比べ,MSEの精度は低下することが示された。
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