論文の概要: Multi-scale super-resolution generation of low-resolution scanned
pathological images
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2105.07200v1
- Date: Sat, 15 May 2021 11:09:05 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-05-18 14:30:42.026797
- Title: Multi-scale super-resolution generation of low-resolution scanned
pathological images
- Title(参考訳): 低分解能走査病理画像のマルチスケール超解像生成
- Authors: Yanhua Gao (1), Ting Xie (2), Xun Wang (2), Qingqing Yang (2), Le Chen
(2), Kai Sun (2), Youmin Guo (1), Gang Yu (2), Kuansong Wang (3) ((1)
Department of Medical Imaging, The First Affiliated Hospital of Xi'an
Jiaotong University, 277 Yanta West Road, Xi'an, 710061, China. (2)
Department of Biomedical Engineering, School of Basic Medical Sciences,
Central South University, 172 Tongzipo Road, Changsha, 410013, China. (3)
Department of Pathology, School of Basic Medical Sciences, Central South
University, 172 Tongzipo Road, Changsha, 410013, China.)
- Abstract要約: 低解像度(5X)でスライドをスキャンする戦略を設計し、診断時に画像の詳細を復元するスーパーレゾリューション手法を提案します。
本手法は,10X,20X,40Xなどの高解像度画像を逐次生成するマルチスケール生成対向ネットワークに基づく。
10種類のヒト組織から10万の病理画像からなるデータセットをネットワークのトレーニングおよびテストのために実施する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Digital pathology slide is easy to store and manage, convenient to browse and
transmit. However, because of the high-resolution scan for example 40 times
magnification(40X) during the digitization, the file size of each whole slide
image exceeds 1Gigabyte, which eventually leads to huge storage capacity and
very slow network transmission. We design a strategy to scan slides with low
resolution (5X) and a super-resolution method is proposed to restore the image
details when in diagnosis. The method is based on a multi-scale generative
adversarial network, which sequentially generate three high-resolution images
such as 10X, 20X and 40X. The perceived loss, generator loss of the generated
images and real images are compared on three image resolutions, and a
discriminator is used to evaluate the difference of highest-resolution
generated image and real image. A dataset consisting of 100,000 pathological
images from 10 types of human tissues is performed for training and testing the
network. The generated images have high peak-signal-to-noise-ratio (PSNR) and
structural-similarity-index (SSIM). The PSNR of 10X to 40X image are 24.16,
22.27 and 20.44, and the SSIM are 0.845, 0.680 and 0.512, which are better than
other super-resolution networks such as DBPN, ESPCN, RDN, EDSR and MDSR.
Moreover, visual inspections show that the generated high-resolution images by
our network have enough details for diagnosis, good color reproduction and
close to real images, while other five networks are severely blurred, local
deformation or miss important details. Moreover, no significant differences can
be found on pathological diagnosis based on the generated and real images. The
proposed multi-scale network can generate good high-resolution pathological
images, and will provide a low-cost storage (about 15MB/image on 5X), faster
image sharing method for digital pathology.
- Abstract(参考訳): デジタル病理スライドは保存と管理が簡単で、閲覧と送信が便利である。
しかし、デジタイズ中の40倍拡大(40x)のような高解像度スキャンのため、スライド画像全体のファイルサイズは1ギガバイトを超え、結果として大きなストレージ容量と非常に遅いネットワーク伝送に繋がる。
我々は低解像度(5X)でスライドをスキャンする手法を設計し、診断時に画像の詳細を復元する超解像法を提案する。
本手法は,10X,20X,40Xなどの高解像度画像を逐次生成するマルチスケール生成対向ネットワークに基づく。
生成画像と実画像の知覚損失、生成損失とを3つの画像解像度で比較し、最高解像度生成画像と実画像の差を判別器を用いて評価する。
10種類のヒト組織から10万の病理画像からなるデータセットをネットワークのトレーニングおよびテストのために実施する。
生成した画像は、高いピーク信号-雑音比(PSNR)と構造相似指数(SSIM)を有する。
10Xから40X画像のPSNRは24.16, 22.27, 20.44であり、SSIMは0.845, 0.680, 0.512であり、DBPN, ESPCN, RDN, EDSR, MDSRなどの超高解像度ネットワークよりも優れている。
また,視覚検査では,ネットワークが生成する高解像度画像には,診断や色再現,実画像に近い詳細情報があり,他の5つのネットワークは著しくぼやけたり,局所的な変形や重要な詳細を見逃したりする。
また, 生成画像と実画像による病理診断では有意な差は認められなかった。
提案するマルチスケールネットワークは,優れた高解像度の病理像を生成でき,低コストのストレージ(約15MB/image on 5X)と高速な画像共有方式を提供する。
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