論文の概要: Covid-19 Detection from Chest X-ray and Patient Metadata using Graph
Convolutional Neural Networks
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2105.09720v2
- Date: Fri, 21 May 2021 12:38:45 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-05-29 19:47:43.008121
- Title: Covid-19 Detection from Chest X-ray and Patient Metadata using Graph
Convolutional Neural Networks
- Title(参考訳): グラフ畳み込みニューラルネットワークを用いた胸部X線および患者メタデータからのCovid-19の検出
- Authors: Thosini Bamunu Mudiyanselage, Nipuna Senanayake, Chunyan Ji, Yi Pan
and Yanqing Zhang
- Abstract要約: 本稿では,Covid-19肺炎のバイオマーカーを同定可能な新しいグラフ畳み込みニューラルネットワーク(GCN)を提案する。
提案手法は,データインスタンスとその特徴間の重要な関係知識をグラフ表現を用いて利用し,グラフデータ学習に畳み込みを適用する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 6.420262246029286
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: The novel corona virus (Covid-19) has introduced significant challenges due
to its rapid spreading nature through respiratory transmission. As a result,
there is a huge demand for Artificial Intelligence (AI) based quick disease
diagnosis methods as an alternative to high demand tests such as Polymerase
Chain Reaction (PCR). Chest X-ray (CXR) Image analysis is such cost-effective
radiography technique due to resource availability and quick screening. But, a
sufficient and systematic data collection that is required by complex deep
leaning (DL) models is more difficult and hence there are recent efforts that
utilize transfer learning to address this issue. Still these transfer learnt
models suffer from lack of generalization and increased bias to the training
dataset resulting poor performance for unseen data. Limited correlation of the
transferred features from the pre-trained model to a specific medical imaging
domain like X-ray and overfitting on fewer data can be reasons for this
circumstance. In this work, we propose a novel Graph Convolution Neural Network
(GCN) that is capable of identifying bio-markers of Covid-19 pneumonia from CXR
images and meta information about patients. The proposed method exploits
important relational knowledge between data instances and their features using
graph representation and applies convolution to learn the graph data which is
not possible with conventional convolution on Euclidean domain. The results of
extensive experiments of proposed model on binary (Covid vs normal) and three
class (Covid, normal, other pneumonia) classification problems outperform
different benchmark transfer learnt models, hence overcoming the aforementioned
drawbacks.
- Abstract(参考訳): 新しいコロナウイルス(covid-19)は、呼吸伝達によって急速に広がる性質のため、重大な課題を提起している。
その結果,PCR (Polymerase Chain Reaction) などの高需要試験の代替として,AIをベースとした迅速な疾患診断法が求められている。
胸部X線(CXR)画像解析は,資源利用率と高速スクリーニングにより,コスト効率の高い放射線撮影技術である。
しかし、複雑な深層傾き(DL)モデルで必要とされる十分かつ体系的なデータ収集はより困難であり、この問題に対処するためにトランスファーラーニングを利用した最近の取り組みがある。
それでも、これらのトランスファー学習モデルは、一般化の欠如とトレーニングデータセットへのバイアスの増加によって、見えないデータのパフォーマンスが低下する。
事前訓練されたモデルからX線のような特定の医用画像領域に移行した特徴の限定的な相関と、少ないデータへの過度な適合は、この状況の原因となる。
そこで本研究では,CXR画像からCovid-19肺炎のバイオマーカーを同定し,患者のメタ情報を検出する新しいグラフ畳み込みニューラルネットワーク(GCN)を提案する。
提案手法は,グラフ表現を用いたデータインスタンスとその特徴間の重要な関係知識を活用し,従来のユークリッド領域の畳み込みでは不可能であるグラフデータ学習に畳み込みを適用する。
2次モデル(コビッド対ノーマル)と3種類の分類問題(コビッド、ノーマル、その他の肺炎)の広範な実験の結果は、異なるベンチマーク移行学習モデルよりも優れており、上記の欠点を克服している。
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