論文の概要: Design to automate the detection and counting of Tuberculosis(TB)
bacilli
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2105.11432v1
- Date: Mon, 24 May 2021 17:41:39 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-05-25 16:46:38.763783
- Title: Design to automate the detection and counting of Tuberculosis(TB)
bacilli
- Title(参考訳): 結核(tb)菌の検出と計数を自動化するための設計
- Authors: Dinesh Jackson Samuel and Rajesh Kanna Baskaran
- Abstract要約: 世界保健機関(WHO)は結核の早期診断に標準的な顕微鏡検査を推奨している。
顕微鏡で、技術者は、どんなTBバシリの存在でも、スミアの視野(FOV)を調べる。
結核菌の検出のためのコンピュータ支援システムを提案し, 感度と特異性の向上を図った。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/
- Abstract: Tuberculosis is a contagious disease which is one of the leading causes of
death, globally. The general diagnosis methods for tuberculosis include
microscopic examination, tuberculin skin test, culture method, enzyme linked
immunosorbent assay (ELISA) and electronic nose system. World Health
Organization (WHO) recommends standard microscopic examination for early
diagnosis of tuberculosis. In microscopy, the technician examines field of
views (FOVs) in sputum smear for presence of any TB bacilli and counts the
number of TB bacilli per FOV to report the level of severity. This process is
time consuming with an increased concentration for an experienced staff to
examine a single sputum smear. The examination demands for skilled technicians
in high-prevalence countries which may lead to overload, fatigue and diminishes
the quality of microscopy. Thus, a computer assisted system is proposed and
designed for the detection of tuberculosis bacilli to assist pathologists with
increased sensitivity and specificity. The manual efforts in detecting and
counting the number of TB bacilli is greatly minimized. The system obtains
Ziehl-Neelsen stained microscopic images from conventional microscope at 100x
magnification and passes the data to the detection system. Initially the
segmentation of TB bacilli was done using RGB thresholding and Sauvola's
adaptive thresholding algorithm. To eliminate the non-TB bacilli from coarse
level segmentation, shape descriptors like area, perimeter, convex hull, major
axis length and eccentricity are used to extract only the TB bacilli features.
Finally, the TB bacilli are counted using the generated bounding boxes to
report the level of severity.
- Abstract(参考訳): 結核は感染性疾患であり、世界でも主要な死因の一つである。
結核の一般的な診断方法は、顕微鏡検査、結核皮膚検査、培養方法、酵素結合免疫測定法(ELISA)および電子鼻システムである。
世界保健機関(WHO)は結核の早期診断に標準的な顕微鏡検査を推奨している。
顕微鏡検査では,スプートゥムスメアの視野 (fov) をtb bacilli の存在条件として検討し,fov 当たり tb bacilli 数を数えて重症度を報告した。
このプロセスは、経験豊富なスタッフが1本のスミアを検査するのに、集中度が高くなる時間を要する。
高評価国の熟練技術者は、過負荷、疲労、顕微鏡の質低下につながる可能性がある。
そこで, 結核菌の検出のためのコンピュータ支援システムを提案し, 感度と特異性の向上を図った。
TBバシリの数を検出・カウントする手作業は、大幅に最小化されている。
従来の顕微鏡から100倍の倍率でziehl-neelsen染色顕微鏡画像を取得し、検出システムへ送信する。
当初、TBバシリのセグメンテーションはRGBしきい値とソーヴォーラの適応しきい値アルゴリズムを用いて行われた。
非TBバシリを粗いレベルセグメンテーションから除去するために、TBバシリの特徴のみを抽出するために、面積、周縁、凸殻、主軸長及び偏心性などの形状記述子を用いる。
最後に、生成した境界ボックスを用いてTBバシリをカウントして重大度を報告する。
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