論文の概要: TransMIL: Transformer based Correlated Multiple Instance Learning for
Whole Slide Image Classication
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2106.00908v1
- Date: Wed, 2 Jun 2021 02:57:54 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-06-04 07:33:20.585598
- Title: TransMIL: Transformer based Correlated Multiple Instance Learning for
Whole Slide Image Classication
- Title(参考訳): TransMIL:全スライド画像の古典化のためのトランスフォーマーベース関連マルチインスタンス学習
- Authors: Zhuchen Shao, Hao Bian, Yang Chen, Yifeng Wang, Jian Zhang, Xiangyang
Ji, Yongbing Zhang
- Abstract要約: マルチプル・インスタンス・ラーニング(MIL)は、スライド画像全体(WSI)に基づく病理診断において、弱い教師付き分類を解決する強力なツールである。
我々は、相関MILと呼ばれる新しいフレームワークを提案し、収束の証明を提供した。
我々は3つの異なる計算病理問題に対する様々な実験を行い、最先端の手法と比較してより優れた性能と高速な収束を実現した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 38.58585442160062
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Multiple instance learning (MIL) is a powerful tool to solve the weakly
supervised classification in whole slide image (WSI) based pathology diagnosis.
However, the current MIL methods are usually based on independent and identical
distribution hypothesis, thus neglect the correlation among different
instances. To address this problem, we proposed a new framework, called
correlated MIL, and provided a proof for convergence. Based on this framework,
we devised a Transformer based MIL (TransMIL), which explored both
morphological and spatial information. The proposed TransMIL can effectively
deal with unbalanced/balanced and binary/multiple classification with great
visualization and interpretability. We conducted various experiments for three
different computational pathology problems and achieved better performance and
faster convergence compared with state-of-the-art methods. The test AUC for the
binary tumor classification can be up to 93.09% over CAMELYON16 dataset. And
the AUC over the cancer subtypes classification can be up to 96.03% and 98.82%
over TCGA-NSCLC dataset and TCGA-RCC dataset, respectively.
- Abstract(参考訳): マルチプル・インスタンス・ラーニング(MIL)は,スライド画像全体(WSI)に基づく病理診断において,弱い教師付き分類を解く強力なツールである。
しかし、現在のMIL法は通常、独立分布と同一分布の仮説に基づいているため、異なるインスタンス間の相関は無視される。
この問題に対処するため,我々は相関型MILと呼ばれる新しいフレームワークを提案し,収束の証明を提供した。
この枠組みに基づいて、形態情報と空間情報の両方を探索するトランスフォーマーベースのMIL(TransMIL)を考案した。
提案するtransmilは,非バランス・バランス・バイナリ/マルチプル分類を効果的に処理でき,可視化と解釈性が向上する。
3つの異なる計算病理問題に対して様々な実験を行い,最先端法と比較して高い性能と高速収束を達成した。
バイナリ腫瘍分類のためのAUCのテストは、CAMELYON16データセットよりも最大93.09%高い。
また、がんサブタイプの分類に関するAUCは、それぞれTGA-NSCLCデータセットとTGA-RCCデータセットよりも96.03%、98.82%である。
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