論文の概要: Machine Learning Based Texture Analysis of Patella from X-Rays for
Detecting Patellofemoral Osteoarthritis
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2106.01700v2
- Date: Fri, 4 Jun 2021 07:56:43 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-06-07 10:52:13.569520
- Title: Machine Learning Based Texture Analysis of Patella from X-Rays for
Detecting Patellofemoral Osteoarthritis
- Title(参考訳): 機械学習を用いた変形性膝関節症診断のためのX線パテラのテクスチャー解析
- Authors: Neslihan Bayramoglu, Miika T. Nieminen, Simo Saarakkala
- Abstract要約: ランドマーク検出ツール(BoneFinder)を用いてROI(Patellar region-of-interest)を自動的に検出した。
次に、LocalBinary Patterns (LBP)に基づく手作りの特徴を抽出し、パテラーテクスチャを記述した。
膝蓋骨遠位端変形性関節症(PFOA)検出のためのテクスチャパッチに直接、エンドツーエンド訓練深部畳み込みニューラルネットワーク(CNN)を用いた。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 3.609538870261841
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Objective is to assess the ability of texture features for detecting
radiographic patellofemoral osteoarthritis (PFOA) from knee lateral view
radiographs. We used lateral view knee radiographs from MOST public use
datasets (n = 5507 knees). Patellar region-of-interest (ROI) was automatically
detected using landmark detection tool (BoneFinder). Hand-crafted features,
based on LocalBinary Patterns (LBP), were then extracted to describe the
patellar texture. First, a machine learning model (Gradient Boosting Machine)
was trained to detect radiographic PFOA from the LBP features. Furthermore, we
used end-to-end trained deep convolutional neural networks (CNNs) directly on
the texture patches for detecting the PFOA. The proposed classification models
were eventually compared with more conventional reference models that use
clinical assessments and participant characteristics such as age, sex, body
mass index(BMI), the total WOMAC score, and tibiofemoral Kellgren-Lawrence (KL)
grade. Atlas-guided visual assessment of PFOA status by expert readers provided
in the MOST public use datasets was used as a classification outcome for the
models. Performance of prediction models was assessed using the area under the
receiver operating characteristic curve (ROC AUC), the area under the
precision-recall (PR) curve-average precision (AP)-, and Brier score in the
stratified 5-fold cross validation setting.Of the 5507 knees, 953 (17.3%) had
PFOA. AUC and AP for the strongest reference model including age, sex, BMI,
WOMAC score, and tibiofemoral KL grade to predict PFOA were 0.817 and 0.487,
respectively. Textural ROI classification using CNN significantly improved the
prediction performance (ROC AUC= 0.889, AP= 0.714). We present the first study
that analyses patellar bone texture for diagnosing PFOA. Our results
demonstrates the potential of using texture features of patella to predict
PFOA.
- Abstract(参考訳): 本研究の目的は, 膝側頭蓋骨関節症(PFOA)の診断におけるテクスチャ機能の評価である。
ほとんどの公衆用データセット(n = 5507膝)の側方視膝x線写真を用いた。
Patellar region-of-interest(ROI)はランドマーク検出ツール(BoneFinder)を使用して自動的に検出される。
次に、LocalBinary Patterns (LBP)に基づく手作りの特徴を抽出し、パテラーテクスチャを記述した。
まず,LBP特徴量からPFOAを検出するための機械学習モデル(Gradient Boosting Machine)を訓練した。
さらに, PFOA検出のためのテクスチャパッチに直接, エンドツーエンドの深層畳み込みニューラルネットワーク(CNN)を用いた。
提案した分類モデルは, 年齢, 性別, 体重指数(BMI), 総WOMACスコア, およびKelgren-Lawrence(KL)グレードなどの, 臨床評価と参加者特性を用いた従来型の基準モデルと比較した。
MOSTパブリックユースデータセットで提供される専門家読者によるPFOA状態のアトラス誘導による視覚的評価をモデルの分類結果として用いた。
予測モデルの性能は, 入力特性曲線 (roc auc) 下の領域, 精度リコール (pr) 曲線平均精度 (ap) 以下の領域, 層状5倍クロス検証設定におけるブライアスコアを用いて評価した。
年齢,性別,BMI,WOMAC,Tybiofemoral KL等を含む最強基準モデルでは,PFOAを推定するためのAUCとAPは0.817,0.487であった。
CNNを用いたテキストROI分類では予測性能が有意に向上した(ROC AUC=0.889, AP=0.714)。
本研究はPFOAの診断のための骨組織構造を解析する最初の研究である。
PFOAを予測するために膝蓋骨のテクスチャ的特徴を用いることの可能性を示した。
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