論文の概要: Self-Improved Retrosynthetic Planning

• arxiv url: http://arxiv.org/abs/2106.04880v1
• Date: Wed, 9 Jun 2021 08:03:57 GMT
• ステータス: 処理完了
• システム内更新日: 2021-06-10 14:57:35.464718
• Title: Self-Improved Retrosynthetic Planning
• Title（参考訳）: 自己改善型再合成計画
• Authors: Junsu Kim, Sungsoo Ahn, Hankook Lee, Jinwoo Shin
• Abstract要約: 再合成計画(Retrosynthetic Planning)は、標的分子を合成する反応の経路を見つけるための化学の基本的な問題である。 最近の検索アルゴリズムは、ディープニューラルネットワーク(DNN)を用いてこの問題を解決するための有望な結果を示している。 そこで本研究では,DNNを直接訓練し,望ましい特性を持つ反応経路を生成するためのエンドツーエンドフレームワークを提案する。
• 参考スコア（独自算出の注目度）: 66.5397931294144
• License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
• Abstract: Retrosynthetic planning is a fundamental problem in chemistry for finding a pathway of reactions to synthesize a target molecule. Recently, search algorithms have shown promising results for solving this problem by using deep neural networks (DNNs) to expand their candidate solutions, i.e., adding new reactions to reaction pathways. However, the existing works on this line are suboptimal; the retrosynthetic planning problem requires the reaction pathways to be (a) represented by real-world reactions and (b) executable using "building block" molecules, yet the DNNs expand reaction pathways without fully incorporating such requirements. Motivated by this, we propose an end-to-end framework for directly training the DNNs towards generating reaction pathways with the desirable properties. Our main idea is based on a self-improving procedure that trains the model to imitate successful trajectories found by itself. We also propose a novel reaction augmentation scheme based on a forward reaction model. Our experiments demonstrate that our scheme significantly improves the success rate of solving the retrosynthetic problem from 86.84% to 96.32% while maintaining the performance of DNN for predicting valid reactions.
• Abstract（参考訳）: 再合成計画(Retrosynthetic Planning)は、標的分子を合成する反応経路を見つけるための化学の基本的な問題である。 近年,探索アルゴリズムは,ディープニューラルネットワーク(dnn)を用いて候補解の拡張,すなわち反応経路に新たな反応を加えることで,この問題に対する有望な結果を示している。 逆合成計画問題では、反応経路を(a)実世界の反応で表現し、(b)「構築ブロック」分子を使って実行可能なものとする必要があるが、dnnはそのような要求を完全に組み込むことなく反応経路を拡張する。 そこで本研究では,DNNを直接訓練し,望ましい特性を持つ反応経路を生成するためのエンドツーエンドフレームワークを提案する。 私たちの主なアイデアは、モデル自体が成功している軌道を模倣するようにトレーニングする自己改善手順に基づいています。 また, 前方反応モデルに基づく新しい反応増強手法を提案する。 提案手法は, 逆合成問題を86.84%から96.32%に改善し, 有効反応予測のためのDNNの性能を維持した。

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