論文の概要: Bootstrap Representation Learning for Segmentation on Medical Volumes
and Sequences
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2106.12153v1
- Date: Wed, 23 Jun 2021 04:37:28 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-06-24 15:22:39.566375
- Title: Bootstrap Representation Learning for Segmentation on Medical Volumes
and Sequences
- Title(参考訳): 医用ボリュームとシーケンスのセグメンテーションのためのブートストラップ表現学習
- Authors: Zejian Chen, Wei Zhuo, Tianfu Wang, Wufeng Xue and Dong Ni
- Abstract要約: 本稿では,隣接するスライスの予測可能性を活用することで,ブートストラップによる自己教師型表現学習手法を提案する。
提案手法のコアとなるのは,局所表現の予測に関する単純かつ直接的な自己スーパービジョンである。
本モデルでは, ACDCでは4.5%, 前立腺癌では1.7%, CAMUSでは2.3%の差で既存手法よりも優れていた。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 15.133897897609735
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: In this work, we propose a novel straightforward method for medical volume
and sequence segmentation with limited annotations. To avert laborious
annotating, the recent success of self-supervised learning(SSL) motivates the
pre-training on unlabeled data. Despite its success, it is still challenging to
adapt typical SSL methods to volume/sequence segmentation, due to their lack of
mining on local semantic discrimination and rare exploitation on volume and
sequence structures. Based on the continuity between slices/frames and the
common spatial layout of organs across volumes/sequences, we introduced a novel
bootstrap self-supervised representation learning method by leveraging the
predictable possibility of neighboring slices. At the core of our method is a
simple and straightforward dense self-supervision on the predictions of local
representations and a strategy of predicting locals based on global context,
which enables stable and reliable supervision for both global and local
representation mining among volumes. Specifically, we first proposed an
asymmetric network with an attention-guided predictor to enforce
distance-specific prediction and supervision on slices within and across
volumes/sequences. Secondly, we introduced a novel prototype-based
foreground-background calibration module to enhance representation consistency.
The two parts are trained jointly on labeled and unlabeled data. When evaluated
on three benchmark datasets of medical volumes and sequences, our model
outperforms existing methods with a large margin of 4.5\% DSC on ACDC, 1.7\% on
Prostate, and 2.3\% on CAMUS. Intensive evaluations reveals the effectiveness
and superiority of our method.
- Abstract(参考訳): そこで本研究では,アノテーションを限定した医用ボリュームとシーケンスセグメンテーションの簡易化手法を提案する。
自己教師付き学習(ssl)の最近の成功は、ラベルなしデータの事前学習を動機付けている。
その成功にもかかわらず、ローカルなセマンティックな差別やボリュームやシーケンス構造への稀な利用が欠如しているため、一般的なSSLメソッドをボリューム/シーケンスセグメンテーションに適応することは依然として困難である。
スライス/フレーム間の連続性とボリューム/シーケンス間のオルガンの共通空間配置に基づいて,隣接するスライスの予測可能性を活用したブートストラップ自己監督表現学習手法を提案する。
本手法の核心は,局所表現の予測に関する単純で分かりやすい自己管理と,グローバルコンテキストに基づく局所表現予測戦略であり,ボリューム間のグローバル表現マイニングと局所表現マイニングの両方に対して安定かつ信頼性の高い監督を可能にする。
具体的には,注意誘導型予測器を備えた非対称ネットワークを提案し,ボリューム/シーケンス間のスライス間の距離特異的な予測と監視を行った。
次に,新しいプロトタイプベースフォアグラウンド・バックグラウンドキャリブレーションモジュールを導入した。
2つの部分はラベル付きおよびラベルなしのデータに基づいて共同で訓練される。
医療用ボリュームとシークエンスの3つのベンチマークデータセットで評価すると、adcdcでは4.5\%dsc、前立腺では1.7\%、camusでは2.3\%という大きなマージンで既存の手法を上回っている。
集中評価は,本手法の有効性と優位性を明らかにする。
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