論文の概要: Positive-unlabeled Learning for Cell Detection in Histopathology Images
with Incomplete Annotations
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2106.15918v1
- Date: Wed, 30 Jun 2021 09:20:25 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-07-01 15:32:23.584160
- Title: Positive-unlabeled Learning for Cell Detection in Histopathology Images
with Incomplete Annotations
- Title(参考訳): 不完全アノテーションを用いた病理組織像における細胞検出のための正ラベル学習
- Authors: Zipei Zhao, Fengqian Pang, Zhiwen Liu, Chuyang Ye
- Abstract要約: 正の未ラベル学習問題として検出ネットワークのトレーニングを定式化する。
乳がん細胞のミトーシス検出のための公開データセットで実験を行った。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.1470070927586016
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Cell detection in histopathology images is of great value in clinical
practice. \textit{Convolutional neural networks} (CNNs) have been applied to
cell detection to improve the detection accuracy, where cell annotations are
required for network training. However, due to the variety and large number of
cells, complete annotations that include every cell of interest in the training
images can be challenging. Usually, incomplete annotations can be achieved,
where positive labeling results are carefully examined to ensure their
reliability but there can be other positive instances, i.e., cells of interest,
that are not included in the annotations. This annotation strategy leads to a
lack of knowledge about true negative samples. Most existing methods simply
treat instances that are not labeled as positive as truly negative during
network training, which can adversely affect the network performance. In this
work, to address the problem of incomplete annotations, we formulate the
training of detection networks as a positive-unlabeled learning problem.
Specifically, the classification loss in network training is revised to take
into account incomplete annotations, where the terms corresponding to negative
samples are approximated with the true positive samples and the other samples
of which the labels are unknown. To evaluate the proposed method, experiments
were performed on a publicly available dataset for mitosis detection in breast
cancer cells, and the experimental results show that our method improves the
performance of cell detection given incomplete annotations for training.
- Abstract(参考訳): 病理組織像における細胞検出は臨床において非常に有用である。
textit{convolutional neural networks} (cnns) は、ネットワークトレーニングにセルアノテーションが必要となる検出精度を向上させるために、セル検出に適用されている。
しかしながら、多種多様で多数のセルがあるため、トレーニングイメージに関心のあるすべてのセルを含む完全なアノテーションは困難である。
通常、不完全なアノテーションは、信頼性を確保するためにポジティブなラベリング結果が慎重に検討されるが、他のポジティブな例(例えば、興味のある細胞など)はアノテーションに含まれない。
このアノテーション戦略は真の負のサンプルに関する知識の欠如につながる。
既存のほとんどのメソッドは、ネットワークトレーニング中に正の負のラベルが付けられていないインスタンスを単純に扱い、ネットワークのパフォーマンスに悪影響を及ぼす可能性がある。
本研究では,不完全アノテーションの問題に対処するために,検出ネットワークのトレーニングを正の未ラベル学習問題として定式化する。
具体的には、負のサンプルに対応する用語を正の正のサンプルとラベルが未知の他のサンプルと近似する不完全アノテーションを考慮して、ネットワークトレーニングにおける分類損失を補正する。
提案法を評価するために, 乳癌細胞におけるmitosis検出のための公開データセットを用いて実験を行い, 不完全アノテーションによる細胞検出性能の向上を実証した。
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