論文の概要: A new smart-cropping pipeline for prostate segmentation using deep
learning networks
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2107.02476v2
- Date: Wed, 7 Jul 2021 07:03:09 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-07-08 11:50:48.131375
- Title: A new smart-cropping pipeline for prostate segmentation using deep
learning networks
- Title(参考訳): 深層学習ネットワークを用いた前立腺セグメンテーションのための新しいスマートクロッピングパイプライン
- Authors: Dimitrios G. Zaridis, Eugenia Mylona, Nikolaos S. Tachos, Kostas
Marias, Nikolaos Papanikolaou, Manolis Tsiknakis, Dimitrios I. Fotiadis
- Abstract要約: MRI画像から前立腺周辺の領域を抽出し,前景画素と背景画素のよりバランスのとれた分布を生成するためのDLベースのパイプラインを提案する。
提案したスマートクロッピングは、評価された前立腺区分けネットワークのセグメンテーション精度の観点から、標準中心収量よりも優れていた。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 4.789043574854139
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Prostate segmentation from magnetic resonance imaging (MRI) is a challenging
task. In recent years, several network architectures have been proposed to
automate this process and alleviate the burden of manual annotation. Although
the performance of these models has achieved promising results, there is still
room for improvement before these models can be used safely and effectively in
clinical practice. One of the major challenges in prostate MR image
segmentation is the presence of class imbalance in the image labels where the
background pixels dominate over the prostate. In the present work we propose a
DL-based pipeline for cropping the region around the prostate from MRI images
to produce a more balanced distribution of the foreground pixels (prostate) and
the background pixels and improve segmentation accuracy. The effect of
DL-cropping for improving the segmentation performance compared to standard
center-cropping is assessed using five popular DL networks for prostate
segmentation, namely U-net, U-net+, Res Unet++, Bridge U-net and Dense U-net.
The proposed smart-cropping outperformed the standard center cropping in terms
of segmentation accuracy for all the evaluated prostate segmentation networks.
In terms of Dice score, the highest improvement was achieved for the U-net+ and
ResU-net++ architectures corresponding to 8.9% and 8%, respectively.
- Abstract(参考訳): MRI(MRI)による前立腺の分節化は難しい課題である。
近年、このプロセスを自動化し、手動アノテーションの負担を軽減するために、いくつかのネットワークアーキテクチャが提案されている。
これらのモデルの性能は有望な結果を得たが、これらのモデルが安全かつ効果的に臨床で使用できるまでには改善の余地がある。
前立腺mr画像分割における大きな課題の1つは、背景画素が前立腺を支配する画像ラベルにおけるクラス不均衡の存在である。
本研究では,MRI画像から前立腺周辺の領域を抽出し,前景画素(前立腺)と背景画素のよりバランスのとれた分布を生成し,セグメンテーション精度を向上させるためのDLベースのパイプラインを提案する。
U-net、U-net+、Res Unet++、Bridge U-net、Dense U-netの5つの有名なDLネットワークを用いて、DL-croppingによるセグメンテーション性能の向上効果を評価する。
提案したスマートクロッピングは、評価された前立腺区分けネットワークのセグメンテーション精度の観点から、標準中心収量よりも優れていた。
Diceのスコアでは、それぞれ8.9%と8%に対応するU-net+とResU-net++アーキテクチャで最高の改善が達成された。
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