論文の概要: Generalizing Nucleus Recognition Model in Multi-source Images via
Pruning
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2107.02500v1
- Date: Tue, 6 Jul 2021 09:36:34 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-07-07 13:46:59.390815
- Title: Generalizing Nucleus Recognition Model in Multi-source Images via
Pruning
- Title(参考訳): プルーニングによるマルチソース画像における核認識モデルの一般化
- Authors: Jiatong Cai, Chenglu Zhu, Can Cui, Honglin Li, Tong Wu, Shichuan
Zhang, Lin Yang
- Abstract要約: Ki67はがんの診断と予後において重要なバイオマーカーであり、Ki67化学染色画像においてその発現を定量化することでその指標を評価することができる。
マルチソースKi67画像の定量的解析は、ドメイン間分布の違いのため、実際は難しい課題である。
本稿では、ドメインに依存しないサブネットワークを統合ドメインシナリオで探索することにより、ドメイン一般化(DG)を改善する新しい手法を提案する。
提案手法は,Ki67 IHC画像のマルチクラス核認識において,特に失われたカテゴリでは優れた性能を示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 15.35665935877394
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Ki67 is a significant biomarker in the diagnosis and prognosis of cancer,
whose index can be evaluated by quantifying its expression in Ki67
immunohistochemistry (IHC) stained images. However, quantitative analysis on
multi-source Ki67 images is yet a challenging task in practice due to
cross-domain distribution differences, which result from imaging variation,
staining styles, and lesion types. Many recent studies have made some efforts
on domain generalization (DG), whereas there are still some noteworthy
limitations. Specifically in the case of Ki67 images, learning invariant
representation is at the mercy of the insufficient number of domains and the
cell categories mismatching in different domains. In this paper, we propose a
novel method to improve DG by searching the domain-agnostic subnetwork in a
domain merging scenario. Partial model parameters are iteratively pruned
according to the domain gap, which is caused by the data converting from a
single domain into merged domains during training. In addition, the model is
optimized by fine-tuning on merged domains to eliminate the interference of
class mismatching among various domains. Furthermore, an appropriate
implementation is attained by applying the pruning method to different parts of
the framework. Compared with known DG methods, our method yields excellent
performance in multiclass nucleus recognition of Ki67 IHC images, especially in
the lost category cases. Moreover, our competitive results are also evaluated
on the public dataset over the state-of-the-art DG methods.
- Abstract(参考訳): Ki67はがんの診断と予後において重要なバイオマーカーであり、Ki67免疫組織化学(IHC)染色画像においてその発現を定量化することでその指標を評価することができる。
しかし,マルチソースki67画像の定量的解析は,画像のばらつき,染色様式,病変型などによるクロスドメイン分布の違いから,実際には困難な課題である。
最近の多くの研究はドメイン一般化(DG)にいくつかの取り組みを行っているが、それでも注目すべき制限がある。
具体的には、Ki67画像の場合、学習不変表現は、ドメインの不足と異なるドメインでミスマッチする細胞カテゴリの助けになる。
本稿ではドメインに依存しないサブネットワークをドメインマージシナリオで検索することでDGを改善する新しい手法を提案する。
部分モデルパラメータは、トレーニング中に単一のドメインからマージされたドメインへのデータ変換によって引き起こされるドメインギャップに従って反復的にプラニングされる。
さらに、様々なドメイン間のクラスミスマッチの干渉をなくすため、マージされたドメインの微調整によってモデルを最適化する。
さらに、フレームワークの異なる部分にプルーニング法を適用することにより、適切な実装を実現する。
既知のDG法と比較して,Ki67 IHC画像のマルチクラス核認識において,特に失われたカテゴリでは優れた性能を示す。
さらに, 最先端DG法に対する公開データセット上での競争結果も評価した。
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