論文の概要: Edge-competing Pathological Liver Vessel Segmentation with Limited
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- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2108.00384v1
- Date: Sun, 1 Aug 2021 07:28:32 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-08-04 08:00:38.705798
- Title: Edge-competing Pathological Liver Vessel Segmentation with Limited
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- Title(参考訳): 限定ラベルを用いたエッジ競合病的肝血管分画
- Authors: Zunlei Feng, Zhonghua Wang, Xinchao Wang, Xiuming Zhang, Lechao Cheng,
Jie Lei, Yuexuan Wang, Mingli Song
- Abstract要約: 病理画像からのMVI検出に適したアルゴリズムはまだ存在しない。
本報告では, 血管, MVI, および腫瘍のグレードをラベルとした522枚のスライド画像を含む, 初めて病理組織学的肝画像データセットを収集する。
本稿では,2つのエッジセグメンテーション・ネットワークと2つのエッジセグメンテーション・ディミネータを含むエッジコンペティング・コンテナ・ネットワーク(EVS-Net)を提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 61.38846803229023
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: The microvascular invasion (MVI) is a major prognostic factor in
hepatocellular carcinoma, which is one of the malignant tumors with the highest
mortality rate. The diagnosis of MVI needs discovering the vessels that contain
hepatocellular carcinoma cells and counting their number in each vessel, which
depends heavily on experiences of the doctor, is largely subjective and
time-consuming. However, there is no algorithm as yet tailored for the MVI
detection from pathological images. This paper collects the first pathological
liver image dataset containing 522 whole slide images with labels of vessels,
MVI, and hepatocellular carcinoma grades. The first and essential step for the
automatic diagnosis of MVI is the accurate segmentation of vessels. The unique
characteristics of pathological liver images, such as super-large size,
multi-scale vessel, and blurred vessel edges, make the accurate vessel
segmentation challenging. Based on the collected dataset, we propose an
Edge-competing Vessel Segmentation Network (EVS-Net), which contains a
segmentation network and two edge segmentation discriminators. The segmentation
network, combined with an edge-aware self-supervision mechanism, is devised to
conduct vessel segmentation with limited labeled patches. Meanwhile, two
discriminators are introduced to distinguish whether the segmented vessel and
background contain residual features in an adversarial manner. In the training
stage, two discriminators are devised tocompete for the predicted position of
edges. Exhaustive experiments demonstrate that, with only limited labeled
patches, EVS-Net achieves a close performance of fully supervised methods,
which provides a convenient tool for the pathological liver vessel
segmentation. Code is publicly available at
https://github.com/zju-vipa/EVS-Net.
- Abstract(参考訳): 微小血管浸潤(MVI)は肝細胞癌の主要な予後因子であり,最も死亡率の高い悪性腫瘍の1つである。
MVIの診断には、肝細胞癌細胞を含む血管を発見し、医師の経験に大きく依存する各血管の数をカウントする必要があるが、主に主観的で時間を要する。
しかし,病理像からのMVI検出に適したアルゴリズムは存在しない。
本稿では,血管,mvi,肝細胞癌を分類した522個のスライド画像を含む最初の病理肝画像データセットを収集した。
MVIを自動診断する第1のステップは、正確な血管分割である。
超大サイズ、マルチスケール血管、ぼやけた血管縁などの病的肝臓画像の特異な特徴は、正確な血管分割を困難にする。
収集したデータセットに基づいて,セグメント化ネットワークと2つのエッジセグメント判別器を含むエッジ競合容器セグメンテーションネットワーク(evs-net)を提案する。
エッジアウェアの自己スーパービジョン機構と組み合わされたセグメンテーションネットワークは、制限されたラベル付きパッチで容器セグメンテーションを行うために考案された。
一方,2つの判別器を導入して,分断された容器と背景が相反的に残存した特徴を含むか否かを判別する。
訓練段階では、エッジの予測位置を比較できる2つの判別器が考案される。
徹底的な実験により、ラベル付きパッチのみを伴って、evs-netは完全に監督された方法の密接な性能を実現し、病的肝血管分画に便利なツールを提供することが示されている。
コードはhttps://github.com/zju-vipa/EVS-Netで公開されている。
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