論文の概要: MixLacune: Segmentation of lacunes of presumed vascular origin
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2108.02483v1
- Date: Thu, 5 Aug 2021 09:41:35 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-08-06 20:26:36.272247
- Title: MixLacune: Segmentation of lacunes of presumed vascular origin
- Title(参考訳): MixLacune: 推定血管起源の漆片の分別
- Authors: Denis Kutnar, Bas H.M. van der Velden, Marta Girones Sanguesa, Mirjam
I. Geerlings, J. Matthijs Biesbroek, Hugo J. Kuijf
- Abstract要約: 血管起源と推定される2段階の分類法を提案する。
データは、"Where is VALDO?
トレーニングセット0.83、検証セット0.84について平均DICEを報告する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.13918848543076062
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Lacunes of presumed vascular origin are fluid-filled cavities of between 3 -
15 mm in diameter, visible on T1 and FLAIR brain MRI. Quantification of lacunes
relies on manual annotation or semi-automatic / interactive approaches; and
almost no automatic methods exist for this task. In this work, we present a
two-stage approach to segment lacunes of presumed vascular origin: (1)
detection with Mask R-CNN followed by (2) segmentation with a U-Net CNN. Data
originates from Task 3 of the "Where is VALDO?" challenge and consists of 40
training subjects. We report the mean DICE on the training set of 0.83 and on
the validation set of 0.84. Source code is available at:
https://github.com/hjkuijf/MixLacune . The docker container hjkuijf/mixlacune
can be pulled from https://hub.docker.com/r/hjkuijf/mixlacune .
- Abstract(参考訳): 血管起源と推定されるラカンは、T1およびFLAIR脳MRIで見られる直径315mmの流体充填キャビティである。
ラックーンの定量化は手動のアノテーションや半自動的/インタラクティブなアプローチに依存しており、このタスクにはほとんど自動的な方法が存在しない。
本研究では,(1) Mask R-CNN による検出,(2) U-Net CNN による分画の2段階的アプローチを提案する。
データは "where is valdo?" のタスク3に由来する。
課題は40の教科から成っています
トレーニングセット0.83、検証セット0.84について平均DICEを報告する。
ソースコードは、https://github.com/hjkuijf/MixLacune で入手できる。
dockerコンテナhjkuijf/mixlacuneはhttps://hub.docker.com/r/hjkuijf/mixlacuneからプルできる。
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