論文の概要: Medulloblastoma Tumor Classification using Deep Transfer Learning with
Multi-Scale EfficientNets
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2109.05025v1
- Date: Fri, 10 Sep 2021 13:07:11 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-09-14 15:26:07.019597
- Title: Medulloblastoma Tumor Classification using Deep Transfer Learning with
Multi-Scale EfficientNets
- Title(参考訳): マルチスケール・エネルギネットを用いた深層移行学習による髄芽細胞腫の分類
- Authors: Marcel Bengs, Michael Bockmayr, Ulrich Sch\"uller, Alexander Schlaefer
- Abstract要約: 本稿では,エンド・ツー・エンドのMB腫瘍分類を提案し,様々な入力サイズとネットワーク次元の一致した移動学習を提案する。
161ケースのデータセットを用いて、より大規模な入力解像度を持つ事前学習されたEfficientNetが、大幅な性能改善をもたらすことを実証した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 63.62764375279861
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Medulloblastoma (MB) is the most common malignant brain tumor in childhood.
The diagnosis is generally based on the microscopic evaluation of
histopathological tissue slides. However, visual-only assessment of
histopathological patterns is a tedious and time-consuming task and is also
affected by observer variability. Hence, automated MB tumor classification
could assist pathologists by promoting consistency and robust quantification.
Recently, convolutional neural networks (CNNs) have been proposed for this
task, while transfer learning has shown promising results. In this work, we
propose an end-to-end MB tumor classification and explore transfer learning
with various input sizes and matching network dimensions. We focus on
differentiating between the histological subtypes classic and
desmoplastic/nodular. For this purpose, we systematically evaluate recently
proposed EfficientNets, which uniformly scale all dimensions of a CNN. Using a
data set with 161 cases, we demonstrate that pre-trained EfficientNets with
larger input resolutions lead to significant performance improvements compared
to commonly used pre-trained CNN architectures. Also, we highlight the
importance of transfer learning, when using such large architectures. Overall,
our best performing method achieves an F1-Score of 80.1%.
- Abstract(参考訳): 小児で最も多い悪性脳腫瘍は髄芽腫(MB)である。
診断は一般に病理組織スライドの顕微鏡的評価に基づいている。
しかし、病理組織学的パターンの視覚のみの評価は退屈で時間を要する課題であり、観察者の変動にも影響される。
したがって、自動MB腫瘍分類は、一貫性と堅牢な定量化を促進することによって病理学者を支援することができる。
近年、畳み込みニューラルネットワーク(cnns)が提案されているが、転送学習は有望な結果を示している。
本稿では,エンド・ツー・エンドのmb腫瘍分類を提案し,様々な入力サイズとマッチングネットワーク次元の転送学習について検討する。
組織学的サブタイプであるclassicとdesmoplastic/nodularの区別に注目した。
そこで本研究では,CNNの全次元を均一にスケールするEfficientNetsを,最近提案した。
161ケースのデータセットを用いて、入力解像度が大きい事前学習されたEfficientNetは、一般的に使用されるCNNアーキテクチャと比較して、大幅な性能向上をもたらすことを示した。
また,このような大規模アーキテクチャを使用する場合,トランスファー学習の重要性も強調する。
その結果,F1スコアは80.1%となった。
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