論文の概要: ImUnity: a generalizable VAE-GAN solution for multicenter MR image
harmonization
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2109.06756v1
- Date: Tue, 14 Sep 2021 15:21:19 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-09-15 15:44:32.282430
- Title: ImUnity: a generalizable VAE-GAN solution for multicenter MR image
harmonization
- Title(参考訳): ImUnity:マルチセンターMR画像調和のための一般化可能なVAE-GANソリューション
- Authors: Stenzel Cackowski, Emmanuel L. Barbier, Michel Dojat, Thomas Christen
- Abstract要約: ImUnityは、効率よく柔軟なMR画像調和のために設計された、オリジナルのディープラーニングモデルである。
VAE-GANネットワークは、混乱モジュールとオプションの生物学的保存モジュールとを結合し、トレーニングデータベースの各対象の異なる解剖学的位置から採取された複数の2Dスライスを使用する。
最終的に、様々なマルチセンター集団研究に使用できる「補正された」MR画像を生成する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: ImUnity is an original deep-learning model designed for efficient and
flexible MR image harmonization. A VAE-GAN network, coupled with a confusion
module and an optional biological preservation module, uses multiple 2D-slices
taken from different anatomical locations in each subject of the training
database, as well as image contrast transformations for its self-supervised
training. It eventually generates 'corrected' MR images that can be used for
various multi-center population studies. Using 3 open source databases (ABIDE,
OASIS and SRPBS), which contain MR images from multiple acquisition scanner
types or vendors and a large range of subjects ages, we show that ImUnity: (1)
outperforms state-of-the-art methods in terms of quality of images generated
using traveling subjects; (2) removes sites or scanner biases while improving
patients classification; (3) harmonizes data coming from new sites or scanners
without the need for an additional fine-tuning and (4) allows the selection of
multiple MR reconstructed images according to the desired applications. Tested
here on T1-weighted images, ImUnity could be used to harmonize other types of
medical images.
- Abstract(参考訳): ImUnityは、効率よく柔軟なMR画像調和のために設計された、オリジナルのディープラーニングモデルである。
vae-ganネットワークは、混乱モジュールと任意の生物学的保存モジュールとを結合し、トレーニングデータベースの各主題の異なる解剖学的位置から取られた複数の2dスライスと、自己教師付きトレーニングのための画像コントラスト変換を使用する。
最終的に、様々なマルチセンター集団研究に使用できる「補正された」MR画像を生成する。
Using 3 open source databases (ABIDE, OASIS and SRPBS), which contain MR images from multiple acquisition scanner types or vendors and a large range of subjects ages, we show that ImUnity: (1) outperforms state-of-the-art methods in terms of quality of images generated using traveling subjects; (2) removes sites or scanner biases while improving patients classification; (3) harmonizes data coming from new sites or scanners without the need for an additional fine-tuning and (4) allows the selection of multiple MR reconstructed images according to the desired applications.
T1強調画像でテストされたImUnityは、他の種類の医療画像の調和に使える。
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