論文の概要: Generative Pre-Trained Transformer for Cardiac Abnormality Detection
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2110.04071v1
- Date: Thu, 7 Oct 2021 12:01:12 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-10-12 09:25:05.566441
- Title: Generative Pre-Trained Transformer for Cardiac Abnormality Detection
- Title(参考訳): 心臓異常検出のための生成前訓練トランス
- Authors: Pierre Louis Gaudilliere, Halla Sigurthorsdottir, Cl\'ementine Aguet,
J\'er\^ome Van Zaen, Mathieu Lemay, Ricard Delgado-Gonzalo
- Abstract要約: Physionet/CinC 2021の課題は、12, 6, 4, 3, 2-lead ECG記録に基づいて、臨床診断を正確に分類することであった。
トランスフォーマーは自然言語処理の分野で大きな成功を収めてきた。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: ECG heartbeat classification plays a vital role in diagnosis of cardiac
arrhythmia. The goal of the Physionet/CinC 2021 challenge was to accurately
classify clinical diagnosis based on 12, 6, 4, 3 or 2-lead ECG recordings in
order to aid doctors in the diagnoses of different heart conditions.
Transformers have had great success in the field of natural language processing
in the past years. Our team, CinCSEM, proposes to draw the parallel between
text and periodic time series signals by viewing the repeated period as words
and the whole signal as a sequence of such words. In this way, the attention
mechanisms of the transformers can be applied to periodic time series signals.
In our implementation, we follow the Transformer Encoder architecture, which
combines several encoder layers followed by a dense layer with linear or
sigmoid activation for generative pre-training or classification, respectively.
The use case presented here is multi-label classification of heartbeat
abnormalities of ECG recordings shared by the challenge. Our best entry, not
exceeding the challenge's hardware limitations, achieved a score of 0.12, 0.07,
0.10, 0.10 and 0.07 on 12-lead, 6-lead, 4-lead, 3-lead and 2-lead test set
respectively. Unfortunately, our team was unable to be ranked because of a
missing pre-print.
- Abstract(参考訳): 心不整脈の診断には心電図の心拍分類が重要である。
Physionet/CinC 2021の課題は,12,6,4,3,2誘導心電図記録に基づいて臨床診断を正確に分類し,心臓疾患の診断に役立てることであった。
過去数年間、トランスフォーマーは自然言語処理の分野で大きな成功を収めてきた。
cincsemでは,反復周期を単語として,信号全体をそれらの単語の列として見ることにより,テキストと周期時系列信号の平行線を描くことを提案する。
これにより、周期的時系列信号に変換器の注意機構を適用することができる。
実装では,複数のエンコーダ層と高密度層を組み合わせたTransformer Encoderアーキテクチャを,それぞれに線形あるいはシグモイドのアクティベーションを付加して生成前トレーニングや分類を行う。
本研究のユースケースは,心電図記録における心拍異常のマルチラベル分類である。
ベストエントリーは、ハードウェアの限界を超えず、それぞれ12リード、6リード、4リード、3リード、および2リードのテストセットで0.12、0.07、0.10、0.10、0.07を達成しました。
残念ながら、私たちのチームはプレプリントの欠如のためにランク付けできなかったのです。
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