論文の概要: Pseudo-label refinement using superpixels for semi-supervised brain
tumour segmentation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2110.08589v1
- Date: Sat, 16 Oct 2021 15:17:11 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-10-19 16:34:15.814131
- Title: Pseudo-label refinement using superpixels for semi-supervised brain
tumour segmentation
- Title(参考訳): 半教師型脳腫瘍分割のためのスーパーピクセルを用いた擬似ラベルリファインメント
- Authors: Bethany H. Thompson, Gaetano Di Caterina, Jeremy P. Voisey
- Abstract要約: 限定アノテーションを用いたニューラルネットワークのトレーニングは、医療領域において重要な問題である。
半教師付き学習は、注釈付きデータが少ないセグメンテーションを学習することでこの問題を克服することを目的としている。
擬似ラベルの精度を向上させるために,スーパーピクセルに基づくフレームワークを提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.6767885381740952
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Training neural networks using limited annotations is an important problem in
the medical domain. Deep Neural Networks (DNNs) typically require large,
annotated datasets to achieve acceptable performance which, in the medical
domain, are especially difficult to obtain as they require significant time
from expert radiologists. Semi-supervised learning aims to overcome this
problem by learning segmentations with very little annotated data, whilst
exploiting large amounts of unlabelled data. However, the best-known technique,
which utilises inferred pseudo-labels, is vulnerable to inaccurate
pseudo-labels degrading the performance. We propose a framework based on
superpixels - meaningful clusters of adjacent pixels - to improve the accuracy
of the pseudo labels and address this issue. Our framework combines superpixels
with semi-supervised learning, refining the pseudo-labels during training using
the features and edges of the superpixel maps. This method is evaluated on a
multimodal magnetic resonance imaging (MRI) dataset for the task of brain
tumour region segmentation. Our method demonstrates improved performance over
the standard semi-supervised pseudo-labelling baseline when there is a reduced
annotator burden and only 5 annotated patients are available. We report
DSC=0.824 and DSC=0.707 for the test set whole tumour and tumour core regions
respectively.
- Abstract(参考訳): 限定アノテーションを用いたニューラルネットワークのトレーニングは、医療領域において重要な問題である。
深層ニューラルネットワーク(dnn)は通常、許容可能なパフォーマンスを達成するために、大きな注釈付きデータセットを必要とするが、医療領域では、専門家の放射線学者からかなりの時間を要するため、特に取得が困難である。
半教師付き学習は、大量の未学習データを活用しながら、注釈付きデータが少ないセグメンテーションを学習することでこの問題を克服することを目的としている。
しかし、擬似ラベルを用いた最もよく知られている手法は、その性能を劣化させる不正確な擬似ラベルに対して脆弱である。
本稿では,隣接画素の有意義なクラスタであるスーパーピクセルに基づくフレームワークを提案し,擬似ラベルの精度を改善し,この問題に対処する。
我々のフレームワークは,スーパーピクセルと半教師付き学習を組み合わせることで,スーパーピクセルマップの特徴とエッジを用いて,トレーニング中に擬似ラベルを精査する。
本手法は脳腫瘍領域分割作業のためのマルチモーダル磁気共鳴画像(MRI)データセットを用いて評価する。
本手法は,アノテータ負荷が減少し,アノテータ患者が5人しかいない場合に,標準的な半教師付き擬似ラベリングベースラインよりも優れた性能を示す。
dsc=0.824 と dsc=0.707 をそれぞれ全腫瘍コア領域と腫瘍コア領域に分類した。
関連論文リスト
- Semi- and Weakly-Supervised Learning for Mammogram Mass Segmentation with Limited Annotations [49.33388736227072]
本稿では,マスセグメンテーションのための半弱教師付き学習フレームワークを提案する。
良好な性能を得るために, 限られた強ラベルのサンプルと十分な弱ラベルのサンプルを用いる。
CBIS-DDSMおよびINbreastデータセットを用いた実験により,本手法の有効性が示された。
論文 参考訳(メタデータ) (2024-03-14T12:05:25Z) - Robust Tumor Segmentation with Hyperspectral Imaging and Graph Neural
Networks [31.87960207119459]
より堅牢でスムーズなセグメンテーションのために,タイルの空間的文脈を利用した改良手法を提案する。
タイルの不規則な形状に対処するため,グラフニューラルネットワーク(GNN)を用いて周辺地域のコンテキスト情報を伝播する。
以上の結果から, 文脈認識型GNNアルゴリズムは, HSI画像上の腫瘍の区切りを頑健に検出できることが示唆された。
論文 参考訳(メタデータ) (2023-11-20T14:07:38Z) - Deep Superpixel Generation and Clustering for Weakly Supervised
Segmentation of Brain Tumors in MR Images [0.0]
本研究は、弱教師付き脳腫瘍セグメント化を実現するために、スーパーピクセル生成モデルとスーパーピクセルクラスタリングモデルを使用することを提案する。
われわれは、Multimodal Brain tumor Challenge 2020データセットからの2Dの磁気共鳴脳スキャンと、パイプラインを訓練するための腫瘍の存在を示すラベルを用いた。
提案手法は平均Dice係数0.691と平均95%Hausdorff距離18.1を達成し,既存のスーパーピクセルベースの弱教師付きセグメンテーション法より優れていた。
論文 参考訳(メタデータ) (2022-09-20T18:08:34Z) - PCA: Semi-supervised Segmentation with Patch Confidence Adversarial
Training [52.895952593202054]
医用画像セグメンテーションのためのPatch Confidence Adrial Training (PCA) と呼ばれる半教師付き対向法を提案する。
PCAは各パッチの画素構造とコンテキスト情報を学習し、十分な勾配フィードバックを得る。
本手法は, 医用画像のセグメンテーションにおいて, 最先端の半教師付き手法より優れており, その有効性を示している。
論文 参考訳(メタデータ) (2022-07-24T07:45:47Z) - Mixed-UNet: Refined Class Activation Mapping for Weakly-Supervised
Semantic Segmentation with Multi-scale Inference [28.409679398886304]
我々は、デコードフェーズに2つの並列分岐を持つMixed-UNetという新しいモデルを開発する。
地域病院や公開データセットから収集したデータセットに対して,いくつかの一般的なディープラーニングに基づくセグメンテーションアプローチに対して,設計したMixed-UNetを評価した。
論文 参考訳(メタデータ) (2022-05-06T08:37:02Z) - Localized Perturbations For Weakly-Supervised Segmentation of Glioma
Brain Tumours [0.5801621787540266]
本研究は,脳腫瘍のセグメンテーションマスクを事前訓練した3次元分類モデルから抽出するための,局所摂動を弱教師付きソリューションとして用いることを提案する。
また,U-netアーキテクチャを用いて,任意の分類において最も関連性の高い領域を見つけるために,3次元スーパーピクセルを利用する新しい摂動法を提案する。
論文 参考訳(メタデータ) (2021-11-29T21:01:20Z) - Many-to-One Distribution Learning and K-Nearest Neighbor Smoothing for
Thoracic Disease Identification [83.6017225363714]
ディープラーニングは、病気の識別性能を改善するための最も強力なコンピュータ支援診断技術となった。
胸部X線撮影では、大規模データの注釈付けには専門的なドメイン知識が必要で、時間を要する。
本論文では、単一モデルにおける疾患同定性能を改善するために、複数対1の分布学習(MODL)とK-nearest neighbor smoothing(KNNS)手法を提案する。
論文 参考訳(メタデータ) (2021-02-26T02:29:30Z) - Weakly-supervised Learning For Catheter Segmentation in 3D Frustum
Ultrasound [74.22397862400177]
超音波を用いた新しいカテーテルセグメンテーション法を提案する。
提案手法は,1ボリュームあたり0.25秒の効率で最先端の性能を実現した。
論文 参考訳(メタデータ) (2020-10-19T13:56:22Z) - Improved Slice-wise Tumour Detection in Brain MRIs by Computing
Dissimilarities between Latent Representations [68.8204255655161]
磁気共鳴画像(MRI)の異常検出は教師なし手法で行うことができる。
本研究では,変分オートエンコーダの潜伏空間における相似関数の計算に基づいて,腫瘍検出のためのスライスワイズ半教師法を提案する。
本研究では,高解像度画像上でのモデルをトレーニングし,再現の質を向上させることにより,異なるベースラインに匹敵する結果が得られることを示す。
論文 参考訳(メタデータ) (2020-07-24T14:02:09Z) - A Spatially Constrained Deep Convolutional Neural Network for Nerve
Fiber Segmentation in Corneal Confocal Microscopic Images using Inaccurate
Annotations [10.761046991755311]
本研究では,スムーズかつロバストな画像分割を実現するために,空間拘束型深部畳み込みニューラルネットワーク(DCNN)を提案する。
提案手法は神経線維分節に対する角膜共焦点顕微鏡(CCM)画像に基づいて評価された。
論文 参考訳(メタデータ) (2020-04-20T16:56:13Z) - 3D medical image segmentation with labeled and unlabeled data using
autoencoders at the example of liver segmentation in CT images [58.720142291102135]
本研究では、畳み込みニューラルネットワークによるセグメンテーションを改善するために、オートエンコーダ抽出機能の可能性を検討する。
コンボリューション・オートエンコーダを用いてラベルのないデータから特徴を抽出し,CT画像における3次元肝セグメンテーションの目標タスクを実行するために,マルチスケールの完全畳み込みCNNを用いた。
論文 参考訳(メタデータ) (2020-03-17T20:20:43Z)
関連論文リストは本サイト内にある論文のタイトル・アブストラクトから自動的に作成しています。
指定された論文の情報です。
本サイトの運営者は本サイト(すべての情報・翻訳含む)の品質を保証せず、本サイト(すべての情報・翻訳含む)を使用して発生したあらゆる結果について一切の責任を負いません。