論文の概要: Semantic Search for Large Scale Clinical Ontologies
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2201.00118v1
- Date: Sat, 1 Jan 2022 05:15:42 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-01-04 13:59:54.873229
- Title: Semantic Search for Large Scale Clinical Ontologies
- Title(参考訳): 大規模臨床オントロジーのセマンティック検索
- Authors: Duy-Hoa Ngo, Madonna Kemp, Donna Truran, Bevan Koopman, Alejandro
Metke-Jimenez
- Abstract要約: 本稿では,大規模臨床語彙検索システムを構築するための深層学習手法を提案する。
本稿では,意味学習データに基づくトレーニングデータを生成するTriplet-BERTモデルを提案する。
このモデルは,5つの実ベンチマークデータセットを用いて評価され,提案手法は自由テキストから概念,概念まで,概念語彙の検索において高い結果が得られることを示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 63.71950996116403
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Finding concepts in large clinical ontologies can be challenging when queries
use different vocabularies. A search algorithm that overcomes this problem is
useful in applications such as concept normalisation and ontology matching,
where concepts can be referred to in different ways, using different synonyms.
In this paper, we present a deep learning based approach to build a semantic
search system for large clinical ontologies. We propose a Triplet-BERT model
and a method that generates training data directly from the ontologies. The
model is evaluated using five real benchmark data sets and the results show
that our approach achieves high results on both free text to concept and
concept to concept searching tasks, and outperforms all baseline methods.
- Abstract(参考訳): クエリが異なる語彙を使用する場合、大きな臨床オントロジーで概念を見つけることは困難である。
この問題を克服する探索アルゴリズムは、概念正規化やオントロジーマッチングのようなアプリケーションで有用であり、異なるシノニムを用いて異なる方法で概念を参照することができる。
本稿では,大規模臨床オントロジーのための意味探索システムを構築するための深層学習に基づくアプローチを提案する。
本稿では,オントロジーから直接トレーニングデータを生成するTriplet-BERTモデルを提案する。
このモデルは5つの実際のベンチマークデータセットを用いて評価され,提案手法は自由テキストから概念,概念検索タスクの両方において高い結果を達成し,すべてのベースラインメソッドを上回った。
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