論文の概要: An Efficient Binary Harris Hawks Optimization based on Quantum SVM for
Cancer Classification Tasks
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2202.11899v1
- Date: Thu, 24 Feb 2022 04:51:05 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-02-26 04:18:55.717436
- Title: An Efficient Binary Harris Hawks Optimization based on Quantum SVM for
Cancer Classification Tasks
- Title(参考訳): 癌分類タスクのための量子svmに基づく効率的なバイナリharris hawks最適化
- Authors: Essam H. Houssein, Zainab Abohashima, Mohamed Elhoseny and Waleed M.
Mohamed
- Abstract要約: この研究は、量子シミュレーターを用いたがん分類のための新しいハイブリッド量子カーネルサポートベクターマシン(QKSVM)と、バイナリハリスホーク最適化(BHHO)に基づく遺伝子選択を組み合わせたものである。
提案手法は大腸および乳房のマイクロアレイデータセットに適用され、BHHOにより全遺伝子および選択された遺伝子で評価される。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 27.169643615242652
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Cancer classification based on gene expression increases early diagnosis and
recovery, but high-dimensional genes with a small number of samples are a major
challenge. This work introduces a new hybrid quantum kernel support vector
machine (QKSVM) combined with a Binary Harris hawk optimization (BHHO) based
gene selection for cancer classification on a quantum simulator. This study
aims to improve the microarray cancer prediction performance with the quantum
kernel estimation based on the informative genes by BHHO. The feature selection
is a critical step in large-dimensional features, and BHHO is used to select
important features. The BHHO mimics the behavior of the cooperative action of
Harris hawks in nature. The principal component analysis (PCA) is applied to
reduce the selected genes to match the qubit numbers. After which, the quantum
computer is used to estimate the kernel with the training data of the reduced
genes and generate the quantum kernel matrix. Moreover, the classical computer
is used to draw the support vectors based on the quantum kernel matrix. Also,
the prediction stage is performed with the classical device. Finally, the
proposed approach is applied to colon and breast microarray datasets and
evaluated with all genes and the selected genes by BHHO. The proposed approach
is found to enhance the overall performance with two datasets. Also, the
proposed approach is evaluated with different quantum feature maps (kernels)
and classical kernel (RBF).
- Abstract(参考訳): 遺伝子発現に基づく癌分類は早期診断と回復を促進するが、少数のサンプルを持つ高次元遺伝子は大きな課題である。
この研究は、量子シミュレーターを用いたがん分類のための新しいハイブリッド量子カーネルサポートベクターマシン(QKSVM)と、バイナリハリスホーク最適化(BHHO)に基づく遺伝子選択を組み合わせたものである。
本研究の目的は、BHHOによる情報的遺伝子に基づく量子カーネル推定により、マイクロアレイ癌予測性能を向上させることである。
機能選択は大規模機能において重要なステップであり、BHHOは重要な機能を選択するために使用される。
BHHOは自然界におけるハリスホークスの協調行動の振る舞いを模倣している。
主成分分析(PCA)は、選択された遺伝子を減らし、キュービット数に適合させる。
その後、量子コンピュータを用いて、還元された遺伝子のトレーニングデータを用いてカーネルを推定し、量子カーネルマトリックスを生成する。
さらに、古典コンピュータは、量子カーネル行列に基づいて支持ベクトルを描画するために使用される。
また、古典装置を用いて予測ステージを実行する。
最後に,提案手法を結腸および乳房のマイクロアレイデータセットに適用し,全遺伝子および選択遺伝子をbhhoにより評価した。
提案手法は,2つのデータセットで全体の性能を向上させる。
また、提案手法は、異なる量子特徴写像(カーネル)と古典的カーネル(RBF)を用いて評価される。
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