論文の概要: Simultaneous Semantic and Instance Segmentation for Colon Nuclei
Identification and Counting
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2203.00157v1
- Date: Tue, 1 Mar 2022 00:25:06 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-03-02 14:18:15.874295
- Title: Simultaneous Semantic and Instance Segmentation for Colon Nuclei
Identification and Counting
- Title(参考訳): 大腸核同定と計数のための同時セマンティックスとインスタンスセグメンテーション
- Authors: Lihao Liu, Chenyang Hong, Angelica I. Aviles-Rivero, Carola-Bibiane
Sch\"onlieb
- Abstract要約: 我々は,同時セマンティクスとインスタンスセグメンテーションのフレームワークとして構成されたソリューションを提案する。
私たちのソリューションは、Colon Nuclei Identification and Counting (CoNIC) Challengeの一部です。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 3.582485486382699
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: We address the problem of automated nuclear segmentation, classification, and
quantification from Haematoxylin and Eosin stained histology images, which is
of great relevance for several downstream computational pathology applications.
In this work, we present a solution framed as a simultaneous semantic and
instance segmentation framework. Our solution is part of the Colon Nuclei
Identification and Counting (CoNIC) Challenge. We first train a semantic and
instance segmentation model separately. Our framework uses as backbone HoverNet
and Cascade Mask-RCNN models. We then ensemble the results with a custom
Non-Maximum Suppression embedding (NMS). In our framework, the semantic model
computes a class prediction for the cells whilst the instance model provides a
refined segmentation. We demonstrate, through our experimental results, that
our model outperforms the provided baselines by a large margin.
- Abstract(参考訳): 本稿では,Haematoxylin および Eosin 染色組織像から得られた自動核分割,分類,定量化の問題点に対処する。
本稿では,セマンティクスとインスタンスセグメンテーションの同時フレームワークとして構成したソリューションを提案する。
私たちのソリューションは、Colon Nuclei Identification and Counting (CoNIC) Challengeの一部です。
まず、セグメンテーションモデルとインスタンスセグメンテーションモデルを別々にトレーニングします。
私たちのフレームワークはbackbone hovernetとcascade mask-rcnnモデルとして使用しています。
次に、結果をNMS(Non-Maximum Suppression Embedding)にまとめます。
我々のフレームワークでは、セマンティックモデルがセルのクラス予測を計算し、インスタンスモデルが洗練されたセグメンテーションを提供する。
実験結果から,提案するモデルでは,提案するベースラインを大きなマージンで上回る結果が得られた。
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