論文の概要: Deep Learning-based Framework for Automatic Cranial Defect
Reconstruction and Implant Modeling
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2204.06310v1
- Date: Wed, 13 Apr 2022 11:33:26 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-04-14 17:41:36.193992
- Title: Deep Learning-based Framework for Automatic Cranial Defect
Reconstruction and Implant Modeling
- Title(参考訳): 深層学習による頭蓋欠陥の自動再構成とインプラントモデリング
- Authors: Marek Wodzinski, Mateusz Daniol, Miroslaw Socha, Daria Hemmerling,
Maciej Stanuch, Andrzej Skalski
- Abstract要約: 本研究の目的は、頭蓋骨欠損の再建とインプラントのモデリングを行うための、頑健で、高速で、完全に自動化された手法を提案することである。
本稿では,修正U-Netアーキテクチャを用いた2段階の深層学習手法を提案する。
次に, 3Dプリンティングが可能なモデルの自動生成に続いて, インプラント形状を改善するための専用反復手順を提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.2020478014317493
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/
- Abstract: The goal of this work is to propose a robust, fast, and fully automatic
method for personalized cranial defect reconstruction and implant modeling.
We propose a two-step deep learning-based method using a modified U-Net
architecture to perform the defect reconstruction, and a dedicated iterative
procedure to improve the implant geometry, followed by automatic generation of
models ready for 3-D printing. We propose a cross-case augmentation based on
imperfect image registration combining cases from different datasets. We
perform ablation studies regarding different augmentation strategies and
compare them to other state-of-the-art methods.
We evaluate the method on three datasets introduced during the AutoImplant
2021 challenge, organized jointly with the MICCAI conference. We perform the
quantitative evaluation using the Dice and boundary Dice coefficients, and the
Hausdorff distance. The average Dice coefficient, boundary Dice coefficient,
and the 95th percentile of Hausdorff distance are 0.91, 0.94, and 1.53 mm
respectively. We perform an additional qualitative evaluation by 3-D printing
and visualization in mixed reality to confirm the implant's usefulness.
We propose a complete pipeline that enables one to create the cranial implant
model ready for 3-D printing. The described method is a greatly extended
version of the method that scored 1st place in all AutoImplant 2021 challenge
tasks. We freely release the source code, that together with the open datasets,
makes the results fully reproducible. The automatic reconstruction of cranial
defects may enable manufacturing personalized implants in a significantly
shorter time, possibly allowing one to perform the 3-D printing process
directly during a given intervention. Moreover, we show the usability of the
defect reconstruction in mixed reality that may further reduce the surgery
time.
- Abstract(参考訳): 本研究の目的は、頭蓋骨欠損のパーソナライズとインプラントモデリングのためのロバストで高速で完全自動的な方法を提案することである。
改良されたU-Netアーキテクチャを用いた2段階の深層学習手法を提案する。また, 3Dプリンティングが可能なモデルの自動生成に続いて, インプラント形状を改善するための専用反復手順を提案する。
異なるデータセットの事例を組み合わせた不完全な画像登録に基づくクロスケース拡張を提案する。
異なる増補戦略に関するアブレーション研究を行い、他の最先端手法と比較する。
我々は,MICCAI会議と共同で,AutoImplant 2021チャレンジで導入された3つのデータセットについて評価を行った。
本研究では,Dice係数と境界Dice係数とハウスドルフ距離を用いて定量的評価を行う。
平均ディス係数、境界ディス係数、およびハースドルフ距離の95%はそれぞれ0.91、0.94、.53mmである。
混合現実における3Dプリンティングと可視化による質的評価を行い,インプラントの有用性を確認する。
3dプリンティングの準備が整った頭蓋インプラントモデルの作成を可能にする完全パイプラインを提案する。
記述された手法は、AutoImplant 2021の課題タスクで1位を獲得した方法の大幅に拡張されたバージョンである。
ソースコードを自由にリリースし、オープンデータセットとともに、結果を完全に再現可能にします。
頭蓋欠損の自動再建により、パーソナライズされたインプラントを極めて短時間で製造することができ、3Dプリンティングプロセスを直接実施することができる。
さらに,複合現実感における欠陥再構成の有用性を示し,手術時間を更に短縮する可能性を示した。
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