論文の概要: Multi-label topic classification for COVID-19 literature with Bioformer
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2204.06758v1
- Date: Thu, 14 Apr 2022 05:24:54 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-04-16 00:37:58.523860
- Title: Multi-label topic classification for COVID-19 literature with Bioformer
- Title(参考訳): Bioformerを用いたCOVID-19文献のマルチラベルトピック分類
- Authors: Li Fang, Kai Wang
- Abstract要約: バイオフォーマーチームによる新型コロナウイルス文献の多ラベルトピック分類課題への参加について述べる。
話題分類タスクを文対分類問題として定式化し、タイトルが第一文、要約が第二文とする。
基準値と比較すると,最良モデルではマイクロ,マクロ,インスタンスベースのF1スコアが8.8%,15.5%,7.4%増加した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 5.552371779218602
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: We describe Bioformer team's participation in the multi-label topic
classification task for COVID-19 literature (track 5 of BioCreative VII). Topic
classification is performed using different BERT models (BioBERT, PubMedBERT,
and Bioformer). We formulate the topic classification task as a sentence pair
classification problem, where the title is the first sentence, and the abstract
is the second sentence. Our results show that Bioformer outperforms BioBERT and
PubMedBERT in this task. Compared to the baseline results, our best model
increased micro, macro, and instance-based F1 score by 8.8%, 15.5%, 7.4%,
respectively. Bioformer achieved the highest micro F1 and macro F1 scores in
this challenge. In post-challenge experiments, we found that pretraining of
Bioformer on COVID-19 articles further improves the performance.
- Abstract(参考訳): バイオフォーマーチームによるCOVID-19文献の多ラベルトピック分類課題(BioCreative VIIのトラック5)への参加について述べる。
異なるBERTモデル(BioBERT、PubMedBERT、Bioformer)を使用してトピック分類を行う。
話題分類タスクを,タイトルが第1文,抽象が第2文である文対分類問題として定式化する。
以上の結果から,BioformerはBioBERTとPubMedBERTよりも優れていた。
ベースライン結果と比較すると,マイクロ,マクロ,インスタンスベースのF1スコアはそれぞれ8.8%,15.5%,7.4%増加した。
バイオフォーマーはこの挑戦でマイクロF1とマクロF1の最高点を達成した。
カオス後の実験では、バイオフォーマーのCOVID-19記事への事前トレーニングにより、パフォーマンスがさらに向上することがわかった。
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