論文の概要: Anatomy-aware Self-supervised Learning for Anomaly Detection in Chest
Radiographs
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2205.04282v1
- Date: Mon, 9 May 2022 13:53:40 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-05-10 16:22:42.886891
- Title: Anatomy-aware Self-supervised Learning for Anomaly Detection in Chest
Radiographs
- Title(参考訳): 胸部x線写真における異常検出のための解剖学的自己教師付き学習
- Authors: Junya Sato, Yuki Suzuki, Tomohiro Wataya, Daiki Nishigaki, Kosuke
Kita, Kazuki Yamagata, Noriyuki Tomiyama, and Shoji Kido
- Abstract要約: 自己教師付き学習(SSL)は、手動のアノテーションなしでデータ固有の特徴を学習する訓練手法である。
解剖学的構造に基づく教師なし異常検出を可能にするSSLベースのモデルを提案する。
我々のモデルは、既存のUADモデルの中で最も高い92.1%、78.7%、81.9%の曲線下面積を示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.7988006111525217
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Large numbers of labeled medical images are essential for the accurate
detection of anomalies, but manual annotation is labor-intensive and
time-consuming. Self-supervised learning (SSL) is a training method to learn
data-specific features without manual annotation. Several SSL-based models have
been employed in medical image anomaly detection. These SSL methods effectively
learn representations in several field-specific images, such as natural and
industrial product images. However, owing to the requirement of medical
expertise, typical SSL-based models are inefficient in medical image anomaly
detection. We present an SSL-based model that enables anatomical
structure-based unsupervised anomaly detection (UAD). The model employs the
anatomy-aware pasting (AnatPaste) augmentation tool. AnatPaste employs a
threshold-based lung segmentation pretext task to create anomalies in normal
chest radiographs, which are used for model pretraining. These anomalies are
similar to real anomalies and help the model recognize them. We evaluate our
model on three opensource chest radiograph datasets. Our model exhibit area
under curves (AUC) of 92.1%, 78.7%, and 81.9%, which are the highest among
existing UAD models. This is the first SSL model to employ anatomical
information as a pretext task. AnatPaste can be applied in various deep
learning models and downstream tasks. It can be employed for other modalities
by fixing appropriate segmentation. Our code is publicly available at:
https://github.com/jun-sato/AnatPaste.
- Abstract(参考訳): 異常の正確な検出には大量のラベル付き医用画像が必要であるが、手動アノテーションは労働集約的かつ時間のかかるものである。
自己教師付き学習(SSL)は、手動のアノテーションなしでデータ固有の特徴を学習する訓練手法である。
いくつかのSSLベースのモデルが医療画像異常検出に使用されている。
これらのSSL手法は、自然および工業製品画像など、フィールド固有の複数の画像の表現を効果的に学習する。
しかし、医学的専門知識の要求により、SSLベースの典型的なモデルは、医用画像異常検出において非効率である。
解剖学的構造に基づく教師なし異常検出(UAD)を可能にするSSLベースのモデルを提案する。
このモデルは解剖学的アウェアペースト(anatpaste)拡張ツールを使用している。
AnatPasteは、しきい値に基づく肺セグメンテーションプレテキストタスクを使用して、正常な胸部X線写真における異常を発生させ、モデル事前訓練に使用される。
これらの異常は実際の異常と似ており、モデルがそれらを認識するのに役立つ。
3つのオープンソースの胸部x線画像データセットを用いて評価を行った。
我々のモデルは、既存のUADモデルの中で最も高い92.1%、78.7%、81.9%の曲線下面積を示す。
これは、プリテキストタスクとして解剖学的情報を使用した最初のSSLモデルである。
AnatPasteはさまざまなディープラーニングモデルや下流タスクに適用できる。
適切なセグメンテーションを固定することで、他のモダリティにも適用することができる。
私たちのコードは、https://github.com/jun-sato/AnatPaste.comで公開されています。
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