論文の概要: Revisiting Whole-Slide Image Pyramids for Cancer Prognosis via
Dual-Stream Networks
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2206.05782v1
- Date: Sun, 12 Jun 2022 16:29:56 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-06-14 14:58:16.926625
- Title: Revisiting Whole-Slide Image Pyramids for Cancer Prognosis via
Dual-Stream Networks
- Title(参考訳): デュアルストリームネットワークによるがん予後診断のための全スライディング画像ピラミッドの再検討
- Authors: Pei Liu, Bo Fu, Feng Ye, Rui Yang, Bin Xu, and Luping Ji
- Abstract要約: 本稿では,WSI(Whole-Slide Images)をモデル化し,がん予後の精度を向上させるための二重ストリームアーキテクチャを提案する。
患者1,911人のうち3,101人のWSIを公開データセットで検証した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 16.726645267120965
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: The cancer prognosis on gigapixel Whole-Slide Images (WSIs) has always been a
challenging task. Most existing approaches focus solely on single-resolution
images. The multi-resolution schemes, utilizing image pyramids to enhance WSI
visual representations, have not yet been paid enough attention to. In order to
explore a multi-resolution solution for improving cancer prognosis accuracy,
this paper proposes a dual-stream architecture to model WSIs by an image
pyramid strategy. This architecture consists of two sub-streams: one is for
low-resolution WSIs, and the other is especially for high-resolution ones.
Compared to other approaches, our scheme has three highlights: (i) there exists
a one-to-one relation between stream and resolution; (ii) a square pooling
layer is added to align the patches from two resolution streams, largely
reducing computation cost and enabling a natural stream feature fusion; (iii) a
cross-attention-based method is proposed to pool high-resolution patches
spatially under the guidance of low-resolution ones. We validate our scheme on
three publicly-available datasets, a total number of 3,101 WSIs from 1,911
patients. Experimental results verify that (1) hierarchical dual-stream
representation is more effective than single-stream ones for cancer prognosis,
gaining an average C-Index rise of 5.0% and 1.8% on a single low-resolution and
high-resolution stream, respectively; (2) our dual-stream scheme could
outperform current state-of-the-art ones, by a 5.1% average improvement of
C-Index; (3) the cancer diseases with observable survival differences could
have different preferences for model complexity. Our scheme could serve as an
alternative tool for further facilitating WSI prognosis research.
- Abstract(参考訳): ギガピクセル全スライド画像(WSI)のガン予後は、常に困難な課題である。
既存のアプローチのほとんどは、シングルレゾリューションイメージのみに焦点を当てている。
画像ピラミッドを利用してWSIの視覚表現を強化するマルチ解像度方式は、まだ十分に注目されていない。
本稿では,がんの予後を精度良くするためのマルチレゾリューションソリューションを検討するために,画像ピラミッド戦略を用いてwsisをモデル化するデュアルストリームアーキテクチャを提案する。
このアーキテクチャは2つのサブストリームで構成されており、1つは低解像度のwsis用、もう1つは特に高解像度のwsis用である。
他のアプローチと比較して、我々のスキームには3つのハイライトがある。
(i) ストリームと解像度の間には一対一の関係がある。
(ii)2つの解像度ストリームからのパッチを整列するために正方形プーリング層を追加し、計算コストを大幅に削減し、自然なストリーム特徴融合を可能にする。
(iii) 低分解能パッチの誘導下で空間的に高分解能パッチをプールするクロスアテンションベース手法を提案する。
患者1,911人のうち3,101人のWSIを公開データセットで検証した。
その結果,(1)階層的二重ストリーム表現は,癌予後において単一ストリームよりも有効であり,1つの低分解能・高分解能ストリームにおいて平均5.0%,1.8%のc-index上昇が得られること,(2)このデュアルストリームスキームは,c-indexの平均5.1%の改善によって,現在の最先端ストリームを上回ることができること,(3)可観測生存率の差があるがん疾患は,モデルの複雑さに対して異なる好みを持つ可能性があること,などが検証された。
提案手法は,wsiの予後研究をさらに促進するための代替ツールとして有用であると考えられる。
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